三轮车非法营运问题主要由公安机关交通管理部门、交通运输主管部门以及城市管理部门协同管理。以下是对各部门职责及执法依据的详细说明，帮助您更好地理解这一问题：

1. 公安机关交通管理部门

   • 职责：该部门主要负责维护社会治安和交通秩序，对违反道路交通安全法律、法规的行为进行处罚。对于非法营运的三轮车，公安机关交通管理部门有权进行查处。
   • 执法依据：依据《中华人民共和国道路交通安全法》，公安机关交通管理部门可以对非法营运行为处以罚款，并可能扣留车辆。

2. 交通运输主管部门

   • 职责：交通运输主管部门在道路运输管理方面负有主要职责，负责对道路运输经营活动进行监督检查。对于未经许可擅自从事道路运输经营的行为，包括三轮车非法营运，该部门有权进行查处。
   • 执法依据：根据《中华人民共和国道路运输条例》，县级以上地方人民政府交通运输主管部门有权责令停止经营，并对未取得道路运输经营许可的非法营运行为处以罚款。

3. 城市管理部门（综合执法部门）

   • 职责：城市管理部门也参与对三轮车非法营运的管理，主要关注其对城市交通秩序、环境卫生和市容市貌的影响。对于乱停乱放、随意揽客等行为，城市管理部门有权进行整治。
   • 执法依据：不同城市可能根据自身实际情况制定了相应的城市管理法规或规章，这些法规或规章通常授予城市管理部门对影响城市秩序行为的执法权。

实际应用中的建议：

• 如果您发现三轮车非法营运行为，可以向上述任一部门进行举报。各部门在接到举报后，会根据其职责范围进行调查处理。
• 对于三轮车非法营运的查处，往往需要多部门协同作战。因此，在实际操作中，各部门之间会加强信息共享和联合执法，以形成合力共同打击非法营运行为。
• 作为市民，您也可以积极参与到打击非法营运的行动中来，通过提高自我保护意识、不乘坐非法营运车辆等方式，共同维护良好的交通秩序和城市环境。

可能涉及的法律后果：

• 对于非法营运的三轮车车主，一旦被查处，将面临罚款、扣留车辆等处罚措施。处罚力度会根据违法行为的严重程度和当地规定而定。
• 如果非法营运行为造成了交通事故或其他严重后果，车主还可能面临更严重的法律责任，包括刑事责任等。

希望以上解答能够帮助您更好地理解三轮车非法营运问题的管理部门及相关法律后果。如果您还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。