关于入职体检查妇科（特别是涉及孕检）是否合法的问题，这主要涉及到我国对于劳动者平等就业权和隐私权的保护。

首先，我们需要明确的是，劳动者的平等就业权是受法律保护的。根据《中华人民共和国就业促进法》的规定，用人单位在招用人员时，除了国家规定的不适合妇女的工种或者岗位外，不得以性别为由拒绝录用妇女或者提高对妇女的录用标准。这意味着，用人单位不能因为女性劳动者的怀孕状态而拒绝录用或提高录用标准。

其次，妇女权益保障法也明确规定了用人单位在招录过程中的限制。该法指出，除国家另有规定外，用人单位不得将妊娠测试作为入职体检项目。这一规定直接回应了您关于入职体检查妇科是否合法的问题，即除非国家有特别规定，否则用人单位不得将孕检作为入职体检的一部分。

再者，怀孕既是个人隐私，也是女性公民的基本权利。入职前的女性劳动者对用人单位没有告知怀孕情况的义务，而强制进行孕检则侵犯了她们的平等就业权和隐私权。因此，对于用人单位提出的入职前孕检要求，劳动者有权予以拒绝。

从实际案例来看，也有法院对类似情况进行了判决。例如，有案例中劳动者在入职前被要求提供孕检报告，并在告知怀孕后被取消了录用资格。法院最终认定用人单位的行为违反了相关法律法规，侵害了劳动者的平等就业权，并判决用人单位承担相应的赔偿责任。

综上所述，入职体检查妇科（特别是涉及孕检）在大多数情况下是不合法的，除非国家有特别规定。用人单位应严格遵守相关法律法规，依法保障劳动者的权益。同时，劳动者在面对不合理的入职体检要求时，也应勇敢地说“不”，并注意收集、留存证据，以便在必要时维护自己的合法权益。