结论：公司因为一次旷工一小时就罚钱，不一定合法，具体取决于公司是否有合法制定的相关规章制度，并且这些制度是否提前告知了员工，同时罚款数额是否合理且不违反法律法规的强制性规定。
法律背景与依据
法律未直接赋予罚款权：
- 自2008年1月15日国务院废止《企业职工奖惩条例》后，我国法律未再直接赋予用人单位对劳动者进行罚款的权力。罚款作为行政处罚权，主要由具有行政处罚权的行政机关实施，用人单位并不包含在内。
规章制度的重要性：
- 虽然直接罚款受限，但用人单位可以通过合法制定的规章制度来管理员工旷工行为。这些规章制度必须满足合法制定、内容合法、提前告知等条件。
合法与不合法的具体情况分析
合法情况：
- 规章制度合法且明确：如果公司有合法制定的规章制度，明确规定了旷工罚款的具体条款，并且这些制度已经提前告知了员工，同时罚款数额合理，不违反法律法规的强制性规定，那么公司可以按照规章制度对旷工员工进行罚款。
- 示例：公司规章制度规定，员工旷工一小时，将扣除当日工资的XX%（这个比例需要合理，不能过高），并且该规章制度已经通过职工代表大会讨论通过，且向员工进行了公示或告知。
不合法情况：
- 缺乏规章制度或制度不合法：如果公司没有相关规章制度，或者规章制度制定不合法（如未经民主程序制定、内容违法等）、未提前告知员工，或者罚款数额过高，违反了法律法规的强制性规定，那么公司就不能直接对旷工员工进行罚款。
- 示例：公司没有明确的旷工罚款制度，或者制度未经职工代表大会讨论通过，或者罚款数额过高（如旷工一小时就扣除全天工资），这些情况下公司的罚款行为都是不合法的。
合法的管理措施
在遵循合法性要求的前提下，公司可以采取以下措施对旷工员工进行管理和约束：
扣减相应工资：
- 根据《工资支付暂行规定》，对于劳动者缺勤的情况，公司可以不支付缺勤期间的工资。但扣除后的工资不得低于当地最低工资标准，以保障劳动者的基本生活需求。
解除劳动合同：
- 如果公司的规章制度明确规定旷工达到一定天数属于严重违反用人单位规章制度，并且该规章制度已经过民主程序制定且向劳动者公示或告知，那么公司可以依据《劳动合同法》第三十九条的规定，以劳动者严重违反用人单位规章制度为由解除劳动合同，且无需支付经济补偿。
员工权益保护
如果公司违反法律规定或规章制度对员工进行不合理罚款，员工有权：
与公司协商解决：
- 员工可以首先尝试与公司协商，要求公司撤销不合理的罚款决定。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商不成，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，请求劳动监察部门介入调查并处理。
申请劳动仲裁：
- 员工还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。
总结与建议：公司在处理员工旷工问题时，应严格遵守法律法规和规章制度的要求，采取合法、合理的管理措施来维护公司的正常运营秩序和员工的合法权益。如果员工对公司的罚款决定有异议，应及时与公司沟通或寻求法律帮助。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。