开发商将楼栋架空层改为商铺出售，这一行为是否合法，需视具体情况而定。以下是从不同角度进行的分析：
一、架空层的产权归属
规划用途决定产权：
- 架空层作为建筑的一部分，其产权归属及用途通常由规划部门在审批时确定。如果规划用途为公共空间、设备层或绿化等非商业用途，那么开发商无权擅自改变其用途并出售。
产权登记情况：
- 若架空层已明确登记在开发商名下，且规划用途允许商业使用，开发商在符合相关法律法规的前提下，理论上可以对其进行改造并出售。但这种情况较为少见，因为架空层通常作为公共空间或配套设施存在。
二、改变用途的合法性
规划变更程序：
- 开发商若想改变架空层的用途，必须首先向规划部门申请变更规划用途。未经批准擅自改变用途，属于违法行为。
业主权益保护：
- 架空层作为小区公共空间的一部分，其改变用途可能影响到业主的合法权益。因此，即使规划用途允许商业使用，开发商在改造前也应征得业主大会或业主委员会的同意，并确保改造后的商铺不会对业主的生活造成不良影响。
三、出售行为的合法性
产权清晰：
- 开发商在出售架空层改造的商铺前，必须确保该商铺的产权清晰，无争议。若产权存在纠纷或未明确登记，出售行为可能无效。
合规销售：
- 开发商在销售商铺时，应遵守相关法律法规，如《商品房销售管理办法》等，确保销售行为合法合规。这包括提供完整的产权证明、销售合同等文件，以及履行信息披露义务等。
四、法律后果
行政处罚：
- 若开发商擅自改变架空层用途并出售，可能面临规划部门的行政处罚，如罚款、责令恢复原状等。
民事纠纷：
- 业主或购房者可能因开发商的违法行为而遭受损失，从而引发民事纠纷。开发商可能需承担赔偿责任，甚至面临合同无效等法律后果。
建议
- 对于开发商：在改造和出售架空层前，务必咨询专业律师，确保行为合法合规，避免引发法律纠纷。
- 对于购房者：在购买此类商铺时，应仔细审查产权证明、规划用途等文件，确保自身权益不受损害。如有疑问，可直接向我咨询。
综上所述，开发商将楼栋架空层改为商铺出售是否合法，需根据架空层的产权归属、改变用途的合法性、出售行为的合法性以及可能面临的法律后果等多方面因素综合判断。