单位负责人借款给合作单位并收取利息，这一行为在法律上是否合法，主要取决于多个因素，包括借款行为的性质、利率的合法性以及是否存在其他违法情形等。以下是对这一问题的详细分析：
一、借款行为的性质
个人行为与职务行为：
- 如果单位负责人是以个人名义借款给合作单位，并收取利息，这通常被视为个人行为。在这种情况下，只要借款合同合法有效，且利率符合法律规定，该行为一般是合法的。
- 如果单位负责人是以单位名义借款给合作单位，并收取利息，这可能涉及职务行为。此时，需要考察单位是否有相关授权或内部规定，以及该行为是否符合单位的利益。如果未经授权或违反单位规定，可能构成违法或违规行为。
合法借贷与非法集资：
- 合法的民间借贷是受到法律保护的。只要双方自愿、平等、公平地签订借款合同，并明确约定利率和还款方式，该行为就是合法的。
- 如果单位负责人以借款为名，实际进行非法集资活动，如向不特定对象吸收资金、承诺高息回报等，这可能构成非法集资犯罪，将受到法律的严厉制裁。
二、利率的合法性
法定利率限制：
- 根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，民间借贷的利率受到法律限制。如果借贷双方约定的利率超过合同成立时一年期贷款市场报价利率的四倍，超过部分的利息约定无效。
- 因此，单位负责人在借款给合作单位时，应确保约定的利率不超过法定上限，否则超出部分的利息将不受法律保护。
复利计算：
- 如果借款合同中约定了复利计算方式，也需要确保复利后的总利率不超过法定上限。否则，超出部分的利息同样无效。
三、其他违法情形
利益输送与腐败：
- 如果单位负责人借款给合作单位并收取利息的行为，实际上是为了进行利益输送或腐败活动，如通过高息回报来收买合作单位的关键人员等，这将构成违法或犯罪行为。
- 在这种情况下，不仅借款行为本身可能无效，单位负责人还可能面临刑事责任的追究。
违反单位规定或行业规范：
- 如果单位有明确规定禁止员工以个人名义或单位名义进行借贷活动，或者该行为违反了行业规范或职业道德准则，那么单位负责人可能因此受到内部处分或行业制裁。
四、法律建议
确保借款合同合法有效：
- 单位负责人在借款给合作单位时，应签订书面借款合同，并明确约定借款金额、利率、还款方式等关键条款。
- 借款合同应符合法律规定的形式和实质要件，以确保其合法有效。
遵守利率限制：
- 单位负责人应确保约定的利率不超过法定上限，以避免超出部分的利息无效。
- 在计算复利时，也应确保复利后的总利率不超过法定上限。
避免利益输送与腐败：
- 单位负责人应确保借款行为出于合法、正当的目的，避免进行利益输送或腐败活动。
- 如果存在任何疑虑或不确定情况，应及时咨询法律专业人士的意见。
遵守单位规定与行业规范：
- 单位负责人应了解并遵守单位的相关规定和行业规范，避免因违反规定而受到内部处分或行业制裁。
综上所述，单位负责人借款给合作单位并收取利息的行为是否合法，取决于借款行为的性质、利率的合法性以及是否存在其他违法情形等多个因素。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。