结论：员工只提前两天申请离职，主要可能面临的法律后果是用人单位可能不批准其离职申请，并可能要求员工承担因未提前通知而给单位造成的损失赔偿责任，但具体后果还需结合实际情况和劳动合同、公司规章制度等综合判断。

详细分析：

1. 劳动合同与规章制度的角度：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者解除劳动合同，应当提前三十日以书面形式通知用人单位（在试用期内提前三日通知）。这是法律对劳动者解除劳动合同程序的基本要求。
   • 如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了员工离职需提前更长时间通知，或者对未提前通知有具体的处罚措施，那么员工只提前两天申请离职，就可能违反了这些规定。
   • 在这种情况下，用人单位有权不批准员工的离职申请，并可能依据劳动合同或规章制度的规定，要求员工承担相应的违约责任或损失赔偿责任。

2. 实际损失的角度：

   • 即使劳动合同或公司规章制度中没有明确规定未提前通知的处罚措施，但如果员工未提前通知离职给用人单位造成了实际损失（如因员工突然离职导致工作无法及时交接，造成业务中断、客户流失等），用人单位也有权要求员工承担赔偿责任。
   • 这种赔偿责任通常需要根据实际损失情况进行具体评估，并可能涉及举证责任的问题。用人单位需要证明员工未提前通知离职与其实际损失之间存在因果关系。

3. 员工权益的角度：

   • 员工有权依法解除劳动合同，但应遵守法律规定的程序和要求。如果员工确实因特殊原因无法提前三十日通知用人单位，可以尝试与用人单位协商，争取得到用人单位的理解和支持。
   • 如果员工未提前通知离职，但用人单位并未因此遭受实际损失，或者损失较小且用人单位未提出赔偿要求，那么员工可能不会面临严重的法律后果。

建议：

• 对于员工而言，在离职前应尽量遵守法律规定的程序和要求，提前与用人单位沟通并办理离职手续，以避免不必要的法律纠纷和损失。
• 对于用人单位而言，应完善劳动合同和公司规章制度，明确员工离职的程序和要求，以及未提前通知的处罚措施和损失赔偿责任等，以维护自身的合法权益。
• 如果双方因离职问题产生纠纷，可以尝试通过协商、调解等方式解决；如果协商、调解无果，可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。

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