您好，关于事业单位降低公积金比例是否合法的问题，这需要根据具体情况和相关法规来判断。
首先，根据《住房公积金管理条例》以及相关指导意见，单位和职工缴存住房公积金的比例是有明确规定的，原则上不应低于5%，也不应高于12%。这一规定是为了保障职工的合法权益，确保住房公积金制度的稳健运行。
然而，在特定情况下，如单位确因生产经营困难，且无法正常缴存住房公积金时，是可以申请降低缴存比例的。但这一申请必须经过严格的程序：
内部审议：需要经过本单位职工（代表）大会或工会的审议通过。如果单位未建立职工代表大会或未设立工会，则需要经过全体职工三分之二以上的同意。
公示：审议通过后，还需要在本单位内部进行公示，通常公示期为五个工作日，以确保所有职工都了解并同意这一决定。
审批：最后，需要向当地的住房公积金管理中心提交申请，并经过其批准后，才能正式降低缴存比例。
以普洱市为例，该市就出台了《普洱住房公积金降低缴存比例和缓缴管理规定》，明确规定了降低缴存比例和缓缴住房公积金的具体条件、程序和所需材料。这一规定既考虑了单位的实际困难，也保障了职工的合法权益。
因此，如果事业单位确实因生产经营困难，且按照上述程序经过审议、公示和审批后，是可以合法降低公积金缴存比例的。但如果没有经过这些程序，或者不符合降低缴存比例的条件，那么擅自降低公积金比例就是不合法的。
希望这个解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告诉我。