结论：工作时间脑梗且超过48小时死亡，一般不算工亡，但在特定条件下，如能证明脑梗与工作有直接关系，则可能被认定为工伤。以下是对此问题的详细分析：

一、一般情况下的工伤认定

1. 脑梗死的性质：脑梗死通常被视为一种疾病，而非工作直接导致的伤害。按照《工伤保险条例》的基本规定，职工在工作时间和工作岗位突发疾病，若未导致死亡或未在48小时之内经抢救无效死亡，一般不被认定为工伤。

2. 非工作因素导致的脑梗死：如果脑梗死是由员工自身的健康问题（如高血压、高血脂等基础性疾病）引发，且这些疾病并非因工作因素诱发或加重，那么在工作时间发生脑梗死，即使超过48小时死亡，也不会被认定为工伤。

二、特定条件下的工伤认定

1. 视同工伤的情形：虽然脑梗死本身一般不被视为工伤，但根据《工伤保险条例》第十五条第一项的规定，职工在工作时间和工作岗位上突发疾病死亡，或者在48小时之内经抢救无效死亡的，视同工伤。然而，您提到的情况是“超过48小时死亡”，因此这一条款在此情况下不适用。

2. 因工作原因导致脑梗死：如果脑梗死的发生能够明确归因于工作原因，如长期高强度工作、工作环境存在有毒有害物质等直接导致的，那么有可能会被认定为工伤。但这种情况下，劳动者需要承担较重的举证责任，必须提供充分的证据来证明疾病与工作之间存在直接的因果关系。这通常需要通过专业的医学鉴定和相关证据来支撑。

三、工伤认定程序与异议处理

1. 申请工伤认定：如果员工或其近亲属认为脑梗死属于工伤，可以向用人单位所在地的社会保险行政部门提出工伤认定申请。申请时需提交医疗诊断证明、事故发生的相关证明材料等。

2. 审查与决定：社会保险行政部门会对申请材料进行审查，并依据相关法律法规和程序作出认定决定。

3. 异议处理：如果劳动者对工伤认定结果有异议，可以依法申请行政复议或者提起行政诉讼，以维护自身合法权益。

四、建议与总结

• 收集证据：如果认为脑梗死与工作有关，应积极收集相关证据，如工作记录、医疗记录、工作环境描述等，以便在申请工伤认定时提供支持。
• 专业鉴定：考虑进行专业的医学鉴定，以确定脑梗死与工作之间的因果关系。
• 及时申请：如果符合工伤认定的条件，应及时向社会保险行政部门提出申请，以免错过申请时限。

综上所述，工作时间脑梗且超过48小时死亡，在一般情况下不算工亡。但如果您能提供充分证据证明脑梗死与工作有直接关系，那么仍有可能被认定为工伤。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。