在职务侵占罪案件中，立案前归还的财物通常不会从犯罪数额中扣除，但可以作为量刑时的从轻处罚情节予以考虑。以下是对这一问题的详细分析：
一、职务侵占罪的定义与构成
根据《中华人民共和国刑法》第二百七十一条，职务侵占罪是指公司、企业或其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的行为。此罪属于公诉案件，一旦实施即构成犯罪，不因后续行为（如归还财物）而改变其犯罪性质。
二、立案前归还财物对定罪与量刑的影响
定罪方面：
- 职务侵占罪的成立并不因立案前归还财物而受到影响。一旦实施了符合该罪构成要件的行为，犯罪即已成立。归还财物不会改变犯罪事实的存在，因此，立案前归还财物不影响定罪。
量刑方面：
- 立案前归还财物是体现犯罪嫌疑人悔罪态度的重要表现，可以在量刑时作为从轻情节予以考虑。根据《最高人民法院关于常见犯罪的量刑指导意见》，退赃、退赔行为可以减少基准刑的30%以下，具体减少幅度需综合考虑犯罪性质、退赃退赔的主动程度及对损害结果的弥补程度等因素。
- 如果侵占的财物数额刚达到“数额较大”的标准，且在立案前及时归还全部款项，并伴有其他从轻情节（如自首、认罪认罚等），有可能被判处缓刑，甚至检察院可能作出不起诉决定。然而，如果侵占数额巨大，即便立案前归还，仍会被判处相应刑罚，只是相比未归还的情况会从轻处罚。
三、不同情况下的具体分析
侵占数额较小且及时归还：
- 若职务侵占的数额未达到立案追诉标准（即三万元以下，具体标准可能因地区而异，但此处以一般标准为例），且在案发前及时归还了侵占的财物，一般情况下，司法机关可能不会作为犯罪处理，因为此类行为的社会危害性相对较小。但需注意，这并不意味着行为完全无罪，而是基于社会危害性和情节轻微性的考量。
侵占数额较大但及时归还：
- 若职务侵占的数额已达到立案追诉标准（即三万元以上），即使在立案前归还了财物，仍然构成职务侵占罪。但归还财物的行为可以作为从轻、减轻处罚的情节。法院在判决时会综合考虑被告人的犯罪情节、悔罪表现等多方面因素，如果被告人能够积极退赃，表现出悔罪态度，法院可能会酌情从轻处罚。
特殊情况：
- 若在立案前，行为人不仅归还了财物，还获得了被害单位的谅解，并表示不追究刑事责任，公安机关可能会考虑不立案或撤案。但这并不改变行为已构成犯罪的事实，只是基于被害单位的意愿和具体情况做出的处理决定。且这种情况较为特殊，需满足多个条件（如数额不大、情节轻微、悔罪表现明显等）。
四、法律建议
- 对于涉嫌职务侵占的行为人：如果已经实施了职务侵占行为，应尽快归还侵占的财物，并主动向公安机关投案自首，表达悔罪态度。这有助于在量刑时获得从轻处理。
- 对于企业：应加强内部管理，完善财务制度和监督机制，防范职务侵占行为的发生。一旦发现职务侵占行为，应及时报警并配合司法机关的调查处理。
综上所述，职务侵占罪立案前归还的财物虽然不能直接免除刑事责任，但可以作为量刑时从轻、减轻处罚的情节。因此，对于涉嫌职务侵占的行为人而言，及时归还财物并表达悔罪态度是非常重要的。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。