非法集资员工一般不能直接将自己的金额扣除，但在特定情况下，可能涉及退赔或责任划分问题，以下从不同角度进行分析：
非法集资案件中的退赔原则
- 在非法集资案件中，退赔通常遵循“全额退赔”原则，即所有参与非法集资的资金，无论是由员工还是其他人员投入，原则上都需要进行退赔。这是因为非法集资行为本身违法，相关资金不受法律保护，且退赔是为了尽可能挽回受害者的损失。
- 员工若也是非法集资的受害者，其投入的资金同样需要纳入退赔范围，不能直接扣除。退赔工作一般由公安机关、法院等司法机关组织进行，按照一定的顺序和比例进行分配。
员工可能承担的法律责任
- 刑事责任：如果员工在非法集资活动中扮演了重要角色，如组织者、领导者或积极参与者，可能构成非法集资罪的共犯，需要承担相应的刑事责任。在这种情况下，员工不仅不能扣除自己的金额，还可能面临罚款、没收财产等处罚。
- 民事责任：即使员工不构成刑事犯罪，但如果其行为对非法集资活动起到了推动作用，或者因过错导致他人损失，也可能需要承担一定的民事赔偿责任。
特殊情况下的金额处理
- 员工自首并积极退赃：如果员工在非法集资案件中主动自首，并积极退还非法所得，包括自己投入的资金（如果这部分资金也被视为非法所得的一部分），可能在量刑时得到从轻或减轻处罚的考虑。但这并不意味着员工可以直接扣除自己的金额，而是作为退赃表现的一部分。
- 员工作为受害者的特殊情况：如果员工能够证明自己在非法集资活动中也是受害者，且其投入的资金并未用于非法集资活动（如被欺骗或误导投入），可能在一定程度上减轻其法律责任。但这种情况需要严格的证据支持，且并不意味着员工可以直接扣除自己的金额，而是可能在退赔过程中得到一定的考虑。
法律建议
- 积极配合调查：如果员工涉及非法集资案件，应积极配合司法机关的调查工作，如实陈述事实，提供相关证据。
- 寻求法律帮助：由于非法集资案件涉及复杂的法律问题，员工应寻求专业律师的帮助，以了解自己的法律权利和义务，以及可能面临的法律责任。
- 关注退赔进展：员工应关注退赔工作的进展，了解自己的资金是否被纳入退赔范围，以及退赔的比例和顺序等信息。
总结来说，非法集资员工一般不能直接将自己的金额扣除。在非法集资案件中，退赔工作遵循一定的原则和程序，员工应积极配合调查，寻求法律帮助，并关注退赔进展。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。