工伤期间，用人单位仅发放底薪是不合法的。职工在停工留薪期内应享受与原工资福利待遇相同的待遇，以下从多个角度为你详细分析：
法律依据与原工资福利待遇的定义
根据《工伤保险条例》第三十三条第一款规定，职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这里的“原工资福利待遇”并非仅指底薪，而是指职工在受伤前正常出勤情况下的应得工资，它涵盖了职工在正常工作状态下的所有货币性收入，包括但不限于基本工资、奖金、津贴和补贴等。例如，若职工在工伤前每月除了底薪外，还有绩效奖金、岗位津贴等收入，那么在停工留薪期内，这些收入都应得到继续支付。
停工留薪期的时长与待遇
停工留薪期一般不超过12个月。若伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。在停工留薪期内，职工的工资福利待遇应与受伤前保持一致，不得有所减少。这意味着，用人单位不能仅按照底薪发放工伤工资，而应按照职工受伤前的实际工资水平进行支付。
底薪与实际工资的差异及法律后果
底薪通常是职工工资的一部分，可能低于职工的实际工资水平。如果单位仅按照底薪发放工伤工资，将导致职工在停工留薪期内的收入降低，这不符合《工伤保险条例》的规定。若单位未按照法律规定支付工伤工资，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求单位补足差额部分。若因此给劳动者造成损害的，单位还应承担赔偿责任。
特殊情况的处理与劳动者权益保护
虽然一般情况下用人单位应按照职工受伤前的实际工资水平支付停工留薪期工资，但也存在某些特殊情况，如职工因工伤导致无法正常工作，需要进行劳动能力鉴定等。在这种情况下，企业与职工可以协商一个较低的工资标准（例如底薪），但这必须基于双方的明确协商，并且企业的相关规定需符合法律法规的要求。然而，这并不意味着企业可以单方面降低工伤期间的工资待遇。
如果发现用人单位在工伤期间仅发放底薪，劳动者可以采取以下措施维护自身合法权益：
综上所述，工伤期间用人单位仅发放底薪是不合法的。职工在停工留薪期内应享受与原工资福利待遇相同的待遇。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。