结论：老板通过微信转账给员工，要求员工将款项退还客户的行为，其合法性需根据具体情况分析，不能一概而论。以下从不同角度进行详细分析：

1. 资金性质与用途：

   • 合法情形：如果这笔款项原本就是客户支付给公司的，且因某种原因（如退款、赔偿等）需要退还给客户，老板通过微信转账给员工，并明确指示员工退还客户，这一行为在资金性质和用途上是合法的。但前提是，该行为需符合公司财务制度和相关法律法规的规定，如确保资金流转的透明性和可追溯性。
   • 非法情形：如果这笔款项并非客户支付给公司的，或者老板要求员工退还客户的款项涉及非法活动（如洗钱、逃税等），则这一行为显然是非法的。员工在此情况下应拒绝执行，并可能面临法律责任。

2. 转账方式与合规性：

   • 微信转账的合规性：微信转账作为一种电子支付方式，本身并不违法。但关键在于转账的目的和用途是否合法。如果转账是为了进行合法的资金退还，且符合公司财务流程和相关法律法规，则是合规的。
   • 潜在风险：然而，微信转账可能存在一些潜在风险，如转账记录可能被篡改或删除，导致资金流转的透明性受到影响。此外，如果转账金额较大或频繁，可能引起税务、反洗钱等监管部门的关注。因此，公司应尽量避免使用个人微信账户进行大额或频繁的资金转账。

3. 员工权益与责任：

   • 员工权益：员工有权了解转账的具体原因和用途，并有权拒绝执行非法或不合规的指令。如果员工对转账行为存在疑虑或担忧，应及时向老板或公司相关部门咨询并寻求解释。
   • 员工责任：如果员工明知转账行为非法或不合规，仍执行老板的指令，则可能面临法律责任。因此，员工在执行转账指令前，应仔细审查转账的合法性和合规性。

4. 建议与措施：

   • 公司层面：公司应建立完善的财务制度和内部控制机制，确保资金流转的透明性和合规性。对于需要退还客户的款项，应通过公司正式账户进行转账，并保留完整的转账记录和凭证。
   • 员工层面：员工在执行转账指令前，应仔细审查转账的合法性和合规性，并保留相关证据。如果发现转账行为存在非法或不合规的情况，应及时向老板或公司相关部门报告，并寻求法律援助。

总结与进一步思考：老板通过微信转账给员工要求退还客户的行为，其合法性需根据具体情况分析。公司应建立完善的财务制度和内部控制机制，确保资金流转的合规性；员工在执行转账指令前应仔细审查其合法性和合规性，并保留相关证据。如有任何疑问或担忧，建议直接向我咨询，以便获得更具体和专业的法律建议。