在综合工时制下，地铁行业员工过夜睡觉休息时间是否算工时，需分情况讨论：

1. 若休息时间被明确安排在工作场所内，且员工不能自由支配
   根据《劳动法》及相关规定，若休息时间被纳入工作周期内（如地铁调度室、值班室等场所的过夜休息），且员工在此期间需保持待命状态、无法自由离开或处理个人事务，则该休息时间应计入综合计算工时。例如，地铁调度员在值班室过夜，虽可短暂休息，但需随时响应突发情况，此类时间属于工时范畴。

2. 若休息时间被明确排除在工作周期外，且员工可自由支配
   若企业通过规章制度或劳动合同明确约定，过夜休息时间（如地铁维修工在非工作日的宿舍休息）不属于工时，且员工在此期间无需承担任何工作职责、可自由安排个人活动（如外出、娱乐等），则该时间不计入综合工时。但需注意，企业需确保休息时间充足，符合《劳动法》关于每日/每周休息时间的规定。

3. 特殊情形：待命时间与工时的界定
   若员工在过夜休息期间需保持电话畅通、定期巡查或处理简单事务（如地铁安保人员夜间巡逻间隙的短暂休息），此类“待命时间”是否计入工时需结合具体证据判断。若待命时间显著限制了员工自由（如无法离开指定区域），则可能被认定为工时；若待命义务较轻（如仅需保持通讯畅通），则可能被排除在外。

实务建议：

• 企业应通过书面协议明确综合工时制的计算周期（如周、月、季）及休息时间安排，避免模糊表述；
  
• 员工需保留考勤记录、排班表等证据，以证明休息时间是否被强制占用；
  
• 若发生争议，可申请劳动仲裁，由仲裁机构结合行业惯例、工作性质及实际履行情况综合判定。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的工时认定问题。