在民事诉讼中，若被告不承认公章或合同章的真实性，需结合举证责任分配、鉴定程序启动、证据链完整性三个核心环节处理。以下是具体分析：

1. 原告需承担初步举证责任

根据《民事诉讼法》第67条及《民法典》第490条（合同成立规则），原告需证明：

• 盖章文件的真实性：提供合同、协议等书面证据原件，证明双方存在法律关系；
• 盖章行为的关联性：通过交易习惯、往来邮件、聊天记录等辅助证据，证明盖章文件系被告真实意思表示。

示例：若原告主张被告签署了借款合同，需提供合同原件，并补充转账记录、催款通知等证据，形成完整证据链。

2. 被告否认盖章真实性的应对

若被告抗辩“公章系伪造”或“非本人加盖”，需分情况处理：

• 被告申请公章鉴定：根据《民事证据规定》第31条，被告可申请对公章真实性进行司法鉴定。此时：
  • 原告需配合提交检材（如合同原件、被告备案公章样本）；
  • 若鉴定结果为“非同一公章”，原告需进一步证明被告存在表见代理（如被告员工持假章签约，但原告有理由相信其有代理权）；
  • 若鉴定结果为“同一公章”，被告抗辩不成立，法院将采信原告证据。
• 被告未申请鉴定但抗辩：若被告仅口头否认但未提供反证或申请鉴定，法院可能根据《民事证据规定》第92条，推定原告证据真实（尤其当原告能证明被告曾使用该公章时）。

3. 关键辅助证据的补充

无论是否启动鉴定，以下证据可强化原告主张：

• 公章备案记录：通过工商部门调取被告公章备案信息，证明合同公章与备案章一致；
• 用章习惯证明：如被告在其他场合使用过同一公章（如过往合同、公告文件）；
• 行为人身份证明：若签约人为被告员工或代理人，需提供授权委托书、劳动合同等，证明其有权代表被告用章。

4. 被告可能承担的法律后果

• 若抗辩不成立：被告需按合同约定履行义务（如还款、交货），并可能承担诉讼费、鉴定费等；
• 若抗辩成立：合同对被告不生效，但原告可主张缔约过失责任（如被告故意泄露公章信息导致原告损失）。

行动建议

1. 立即固定证据：对合同原件、往来沟通记录进行公证或电子存证；
2. 申请法院调查：若被告拒不配合提供公章样本，可申请法院向工商部门调取备案信息；
3. 谨慎启动鉴定：鉴定费用通常由申请方预交，若原告对公章真实性有充分信心，可主动申请以终结争议。

如需进一步分析具体案情（如合同类型、被告抗辩理由等），可直接向我提供细节，我会结合司法实践给出针对性建议。