针对被告提交了原告签字的证明，但原告不承认的情况，可以从以下几个角度进行分析和处理：

1. 证明的真实性与合法性审查：

   • 首先，需要确认这份证明是否真实存在，以及其来源是否合法。如果证明是伪造的或者通过非法手段获取的，那么它自然不能作为有效的证据。
   • 审查证明上的签字是否确实是原告的笔迹。这可以通过笔迹鉴定来进行确认。如果笔迹鉴定结果显示签字并非原告所签，那么这份证明的真实性就会受到严重质疑。

2. 原告的否认与举证责任：

   • 原告否认签字是其本人所为，这是原告的权利。然而，在法律程序中，仅仅否认是不够的，原告可能需要提供一定的证据来支持其否认，比如提供其他证据证明其在该时间段内并未签署此类文件，或者证明其签字习惯与该证明上的签字不符等。
   • 同时，被告作为提交证据的一方，也需要承担证明该证据真实性和合法性的责任。如果被告无法提供足够的证据来支持其主张，那么该证据可能会被法院排除。

3. 法律程序与证据规则：

   • 在诉讼过程中，法院会依据相关的证据规则来审查和判断证据的效力。这包括证据的真实性、合法性、关联性等方面。
   • 如果原告对证明上的签字提出异议，法院可能会要求双方进行笔迹鉴定或者其他形式的证据验证。根据鉴定结果或者其他证据，法院会作出相应的判断。

4. 可能的法律后果与解决方案：

   • 如果法院最终认定证明上的签字并非原告所签，或者证明存在其他瑕疵导致其不能作为有效证据，那么被告可能会面临败诉的风险。
   • 在这种情况下，被告可以考虑与原告进行和解或者重新收集证据。同时，原告也可以根据实际情况选择是否继续追究被告的责任或者提出其他诉求。

针对此情况，建议采取以下措施：

• 如果原告确实否认签字是其本人所为，并且有合理的理由和证据支持其否认，那么原告应该及时向法院提出异议，并配合法院进行相关的证据验证工作。
• 被告在提交证据时，应该确保证据的真实性和合法性，避免因为证据问题而导致败诉。如果被告对证明上的签字有疑问或者不确定，也可以考虑进行笔迹鉴定或者其他形式的证据验证。
• 在整个诉讼过程中，双方都应该保持冷静和理性，遵循法律程序和证据规则，通过合法途径来解决争议。

如果有任何具体的法律问题或者需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。