员工使用走逃发票的行为，企业应当依法处理，具体处理方式需结合行为性质、后果及企业制度综合判断，核心结论如下：

1. 明确走逃发票的法律性质
   走逃发票是指开票方在未履行纳税义务或未按规定申报的情况下，擅自开具或非法获取的发票，通常涉及虚开发票、偷逃税款等违法行为。根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十二条，任何单位和个人不得为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，不得让他人为自己开具或介绍他人开具此类发票。员工使用走逃发票，可能直接构成“让他人为自己虚开发票”的违法行为。

2. 企业处理原则：区分主观故意与过失

   • 若员工主观故意使用走逃发票（如为套取资金、偷逃税款等目的）：
     企业应立即停止该行为，追回已报销款项，并依据内部制度（如《员工手册》《财务管理制度》）对员工进行严肃处理，包括但不限于警告、记过、解除劳动合同等。同时，企业需向税务机关主动报告，配合调查，避免因员工行为导致企业被认定为“善意取得虚开发票”外的其他责任（如共同违法）。
     
   • 若员工因过失使用走逃发票（如未尽审核义务，误收走逃发票）：
     企业可要求员工书面说明情况，限期整改（如补开合规发票），并根据内部制度给予轻度处分（如口头警告、扣减绩效）。但需注意，过失不免除企业作为纳税人的审核责任，企业仍需承担因发票不合规导致的税款补缴、滞纳金等后果。

3. 税务合规与风险防控

   • 企业责任：根据《企业所得税法》第八条，企业实际发生的与取得收入有关的、合理的支出，准予在计算应纳税所得额时扣除。但使用走逃发票的支出，因无法证明业务真实性，不得税前扣除，需做纳税调增。若企业未履行审核义务，可能被税务机关认定为“未按规定取得发票”，面临罚款（如《税收征收管理法》第六十四条，处未缴或少缴税款50%以上5倍以下的罚款）。
     
   • 防控措施：企业应建立发票审核机制，要求员工提供发票时同步提交业务合同、付款凭证等佐证材料；定期培训财务人员识别走逃发票特征（如开票方已注销、发票代码异常等）；与税务机关保持沟通，及时核验发票真伪。

4. 员工法律责任
   员工使用走逃发票的行为，可能涉及以下法律责任：

   • 行政责任：根据《发票管理办法》第三十七条，虚开发票的，由税务机关没收违法所得；虚开金额在1万元以下的，可并处5万元以下的罚款；虚开金额超过1万元的，并处5万元以上50万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
     
   • 刑事责任：若走逃发票涉及虚开增值税专用发票，且虚开税款数额较大（如虚开税款数额1万元以上或致使国家税款被骗取5000元以上），可能构成《刑法》第二百零五条规定的“虚开增值税专用发票罪”，处三年以下有期徒刑或拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金；数额巨大或有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金。

建议：企业发现员工使用走逃发票后，应第一时间固定证据（如发票复印件、业务合同、审批记录等），内部调查行为性质，并根据调查结果依法处理。若涉及重大税务风险，可委托专业律师协助与税务机关沟通，制定合规整改方案。如有具体案件或细节需进一步分析，可直接向我咨询。