结论前置：在仅签署合作协议而未签劳动合同的情况下，法律认定需依据协议内容及双方实际权利义务关系。若构成事实劳动关系，用人单位可能面临支付二倍工资等法律责任。因此，建议明确合作性质并及时签订相应合同以保障双方权益。

1. 合作协议与劳动合同的区别

   • 合作协议：主要用于确立双方在特定项目或业务上的合作关系，强调平等主体间的权利义务分配，如共同投资、收益分享和风险共担。此关系下，双方不存在管理与被管理的人身隶属关系。

   • 劳动合同：则是用人单位与劳动者之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的法定协议。劳动者需接受用人单位的管理，遵守其规章制度，并获取劳动报酬。

2. 法律后果分析

   • 若认定为合作关系：双方按合作协议约定履行义务。如一方违约，另一方可依据协议追究违约责任。

   • 若认定为劳动关系（即使未签书面劳动合同）：若具备劳动关系的实质要件（如劳动者受用人单位管理、提供劳动是用人单位业务的组成部分、用人单位支付劳动报酬等），则视为存在事实劳动关系。此时，用人单位可能因未签劳动合同而承担法律责任，包括向劳动者支付二倍工资（自用工之日起超过一个月不满一年）或视为已订立无固定期限劳动合同（自用工之日起满一年）。

3. 对劳动者和用人单位的建议措施

   • 劳动者角度：

     • 应收集能证明劳动关系存在的证据，如工资支付记录、工作证、考勤记录、工作邮件、同事证言等。
     • 如认为与单位构成劳动关系且权益受损，可与单位协商，协商不成可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

   • 用人单位角度：

     • 若双方实为合作关系，应确保合作协议条款清晰，避免模糊表述导致被误认为劳动关系。
     • 若实际属于劳动关系，应及时与劳动者补签劳动合同，以避免法律风险和经济赔偿责任。

4. 法律背景与依据

   • 根据《劳动合同法》等相关法律法规，用人单位与劳动者建立劳动关系应当订立书面劳动合同。未订立书面劳动合同的，用人单位可能面临支付双倍工资等法律责任。
   • 合作协议与劳动合同在法律上具有不同含义和后果。为确保双方权益，建议明确合作性质并及时签订相应合同。

综上所述，对于和员工签订合作协议而不签劳动合同的情况，法律认定需依据协议内容及双方实际权利义务关系。为避免潜在的法律风险和经济赔偿责任，建议用人单位和劳动者明确合作性质并及时签订相应合同。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。