关于医院年终不发乡村医生公卫补贴是否违法的问题，这主要涉及到乡村医生基本公共卫生服务项目经费的发放与管理。以下是我为您提供的详细解答：
首先，根据国务院办公厅印发的《关于进一步加强乡村医生队伍建设的实施意见》以及相关政策文件，乡村医生在承担基本公共卫生服务任务时，应当获得相应的经费补助。这些经费补助是乡村医生合理收入的重要组成部分，也是保障其正常工作和生活的重要措施。
其次，从实际操作和案例来看，如果医院或相关部门拖欠乡村医生的基本公共卫生服务项目经费，是违反政策规定的。例如，南充市阆中市就曾因拖欠乡村医生基本公共卫生服务项目经费而被国办督查室督办，并最终足额发放了拖欠的经费。这一案例表明，拖欠乡村医生公卫补贴是会被严肃处理的，也体现了政策对于保障乡村医生权益的坚定立场。
那么，针对您提出的问题，如果医院年终不发乡村医生公卫补贴，这很可能构成违法行为，至少也是违反了相关政策规定。乡村医生有权要求医院或相关部门按照政策规定及时足额发放公卫补贴。
如果乡村医生遇到此类问题，建议采取以下措施：
与医院或相关部门沟通：首先尝试与医院或负责发放公卫补贴的部门进行沟通，了解拖欠的具体原因和发放计划。
向上级部门反映：如果沟通无果，可以向当地卫生健康行政部门或上级政府反映情况，寻求帮助和支持。
寻求法律援助：在必要时，可以寻求法律援助，通过法律途径维护自己的合法权益。
综上所述，医院年终不发乡村医生公卫补贴是违反政策规定的，乡村医生有权要求及时足额发放。如果遇到此类问题，建议采取积极措施维护自己的权益。