针对您提出的“员工入职两天自离了，可以不发工资吗”这一问题，我的明确回答是：不可以不发工资。
法律依据与原则
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条以及《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，用人单位必须以货币形式按月支付给劳动者本人，且不得克扣或无故拖欠。这一原则适用于所有劳动者，无论其工作时间长短或离职方式如何。因此，员工入职两天并已付出劳动，用人单位就应当支付这两天的工资。
工资计算与支付细节
工资计算：
- 如果双方有明确的日工资标准，那么直接按照日工资乘以工作天数（即2天）来计算应支付的工资。
- 如果没有明确的日工资标准，那么可以依据月工资标准除以月计薪天数（通常为21.75天）来折算日工资，再据此计算两天的工资总额。
支付时间：
- 根据相关规定，劳动关系解除或终止时，用人单位应立即结清并支付劳动者工资。因此，在员工自离的情况下，用人单位也需在合理时间内支付这两天的工资，通常建议是在离职时即时支付。
特殊情况处理
- 即使员工自离，如果其工作期间没有给用人单位造成经济损失，或者经济损失的赔偿不涉及工资的扣除，那么用人单位仍然需要全额支付这两天的工资。
- 如果员工在工作中存在故意或重大过失，给用人单位造成了经济损失，用人单位可以按照劳动合同的约定或相关法律法规要求赔偿。但赔偿款的扣除需遵循法律规定，即每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。这并不意味着可以因此不发工资。
维权途径
如果用人单位拒绝支付这两天的工资，劳动者可以通过以下合法途径维护自身权益：
- 首先尝试与用人单位协商解决；
- 如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉；
- 还可以申请劳动仲裁，通过法律程序追讨应得工资。
综上所述，员工入职两天后自离，用人单位必须依法支付其应得的工资。这是保障劳动者合法权益的重要法律规定，用人单位应严格遵守。同时，劳动者在遭遇此类情况时，也应知晓自己的权利，并通过合法途径积极维权。