针对您提出的“员工自离未办理离职手续是否可以不发工资”的问题，我可以明确地告诉您：员工自离未办理离职手续，用人单位仍需支付其应得的工资，不能以此为由克扣或拒发。
法律依据
这一结论主要基于我国《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定。特别是《中华人民共和国劳动法》第五十条明确指出：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”这一规定清晰地界定了用人单位在工资支付方面的义务，即必须按时足额支付劳动者的工资，且不得无故拖欠或克扣。
详细分析
劳动关系与工资支付的关系：
- 员工自离虽然未办理离职手续，但只要存在事实上的劳动关系（即员工为用人单位提供了劳动），用人单位就应当支付相应的劳动报酬。
- 离职手续的办理是用人单位内部管理流程的一部分，它并不影响员工已经为用人单位提供劳动的事实，因此不能作为拒绝支付工资的理由。
用人单位的责任：
- 用人单位在员工自离后，应积极与员工沟通，催促其办理离职手续，并结清工资。
- 如果员工拒绝配合，用人单位可以通过合法途径解决，如发送催告函、提起劳动仲裁等，但这些措施都不能成为扣留员工工资的理由。
特殊情况的处理：
- 如果员工自离确实给用人单位造成了经济损失（如工作交接未完成导致业务受损、招聘费用损失等），用人单位可以依法要求员工承担赔偿责任。
- 但这一要求必须基于充分的证据证明损失的存在和具体数额，并且要通过合法的途径来主张，如协商、劳动仲裁或诉讼等。用人单位不能直接在工资中扣除赔偿费用，因为这与工资支付是两个独立的法律问题，不能相互抵消。
实际操作建议
- 及时沟通：发现员工自离后，用人单位应第一时间与员工取得联系，了解其离职原因和意愿，并催促其尽快办理离职手续。
- 保留证据：妥善保存与员工之间的劳动合同、考勤记录、工资支付凭证等相关证据，以备不时之需。
- 依法处理：如果员工拒绝配合办理离职手续或结清工资，用人单位可以通过劳动仲裁或诉讼等法律途径维护自身权益。
综上所述，员工自离未办理离职手续并不能成为用人单位拒绝支付工资的理由。用人单位应依法履行工资支付义务，并积极采取措施维护自身权益。同时，员工也应遵守相关法律法规和劳动合同约定，确保离职手续的及时办理。