针对收到骚扰短信，公司可以采取以下处理措施：

1. 内部调查与证据固定
   公司应首先启动内部调查程序，核实骚扰短信的发送主体（如是否为员工、客户或外部人员所为）。需固定关键证据，包括但不限于：短信内容截图、发送时间、发送号码、接收记录等。若涉及员工违规，应调取公司通讯记录、监控录像等辅助证据。根据《民法典》第1032条，自然人享有隐私权，任何组织或个人不得以刺探、侵扰等方式侵害他人隐私权，公司有义务防止内部人员实施此类行为。

2. 分类处理机制

   • 若为内部员工所为：
     根据公司规章制度（如《员工手册》《信息安全管理制度》）明确处罚措施。轻微违规可采取警告、培训等措施；情节严重（如多次发送、涉及侮辱诽谤）可依据《劳动合同法》第39条解除劳动合同，并保留追究民事赔偿的权利。
     
   • 若为外部人员所为：
     立即向运营商投诉（如中国移动10086、中国联通10010），要求屏蔽号码或限制发送；若涉及商业诋毁、诈骗等违法行为，应向公安机关报案（《治安管理处罚法》第42条对“发送淫秽、侮辱、恐吓信息”可处5日以下拘留或500元以下罚款）。

3. 技术防护与制度完善

   • 部署短信过滤系统，通过关键词拦截、黑名单功能减少骚扰信息；
     
   • 完善《信息安全管理制度》，明确员工使用公司通讯设备的规范（如禁止私自泄露客户信息、禁止发送与工作无关内容）；
     
   • 定期开展合规培训，强调《网络安全法》《个人信息保护法》中关于数据保护的义务。

4. 法律救济途径

   • 民事索赔：若骚扰短信导致公司名誉受损或商业利益损失，可依据《民法典》第179条要求侵权人停止侵害、赔偿损失；
     
   • 行政投诉：向市场监管部门举报不正当竞争行为（如竞争对手通过骚扰短信诋毁商誉）；
     
   • 刑事控告：若短信内容涉及敲诈勒索、传播淫秽物品等犯罪行为，可直接向公安机关报案。

温馨提示：处理过程中需注意平衡员工隐私权与公司管理权，避免过度监控引发劳动争议。如有具体案例或证据材料，可进一步向我提供细节，我将协助制定针对性方案。