关于您提出的“上年请了病假年终奖被扣，明年公司能否扣法定年假”的问题，结论前置如下：
一般情况下，公司不能仅因上年请病假而扣除明年的法定年假。法定年假是劳动者依法享有的休息休假权利，与年终奖的发放无直接关联。
若公司规章制度中有明确且合法合理的规定，且该规定已履行民主程序并公示，可能存在扣除年假的特定情形。但这种情况较为特殊，且需严格符合法律规定。
详细分析如下：
一、法定年假的性质与规定
法定年假是劳动者根据工作年限依法享有的带薪休假权利，旨在保障劳动者的休息权，提高工作效率和生活质量。根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者连续工作一年以上的，享受带薪年休假。年休假的天数根据劳动者的工作年限确定，且用人单位应当保证劳动者享受年休假。
二、年终奖与法定年假的关系
年终奖是用人单位根据自身经营状况和劳动者的工作表现，在年底或年初向劳动者发放的奖励性报酬。它属于工资的一部分，但并非法定必须发放的福利。年终奖的发放通常与劳动者的工作表现、出勤情况、公司效益等因素有关。然而，法定年假的享受与年终奖的发放是两个独立的法律关系，公司不能因劳动者上年请病假而扣除其明年的法定年假。
三、公司规章制度的影响
虽然公司有权依法制定规章制度，包括年终奖的发放条件和年假的管理规定，但这些规定必须合法、合理，且不得违反国家法律法规和劳动政策。如果公司规章制度中明确规定，员工请病假达到一定天数或频次会影响年终奖的发放，并且这些规定已经履行了民主程序（如经过职工代表大会讨论通过）并已向员工公示，那么在符合该规定的情形下，公司扣除年终奖可能是合理合法的。但是，这并不意味着公司可以因此扣除员工的法定年假。因为法定年假是劳动者的法定权利，不受公司规章制度中关于年终奖发放条件的影响。
四、劳动者权益保护
如果公司仅因您上年请病假而扣除您明年的法定年假，这种行为可能侵犯了您的合法权益。您有权向公司提出异议，并要求公司按照法律规定安排您享受法定年假。如果公司拒绝改正，您可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
建议与行动指南：
了解公司规章制度：首先，建议您详细了解公司的规章制度中关于年终奖发放和年假管理的规定，确保自己的权益不受侵害。
与公司沟通协商：如果您认为公司的做法不合理，可以与公司进行沟通协商，表达自己的诉求和理由，争取达成共识。
寻求法律援助：如果沟通协商无果，您可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，必要时也可以咨询我，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。