关于请病假扣年终奖是否合法的问题，主要取决于用人单位的规章制度以及相关法律法规的适用情况。以下是从不同角度进行的详细分析：
用人单位规章制度的角度：
- 规章制度的重要性：年终奖作为用人单位给予员工的一种福利，其发放条件、标准、方式等通常由用人单位的内部规章制度决定。因此，规章制度中是否明确规定了病假与年终奖的关系，是判断扣年终奖是否合法的关键。
- 规章制度的合法性：规章制度必须经过民主程序制定，并向劳动者公示告知，才能作为年终奖扣除的依据。如果规章制度未经民主程序制定或未向劳动者公示，那么其规定可能不具备法律效力，用人单位不得据此扣除员工年终奖。
- 规章制度的合理性：即使规章制度中明确规定了病假与年终奖的关系，用人单位在扣除年终奖时也应遵循合理性原则。对于因严重疾病需要长时间治疗休息的员工，用人单位应给予适当照顾，避免过度扣除年终奖。
法律法规的角度：
- 劳动法的规定：根据《中华人民共和国劳动法》第四十七条，用人单位有权自主确定本单位的工资分配方式和工资水平，包括年终奖的发放。但这并不意味着用人单位可以随意扣除员工年终奖，扣除必须有明确的规章制度依据，且金额必须合理。
- 劳动者权益保护：员工生病请病假是合法且必要的，用人单位不应因员工正常医疗需求而过度惩罚。如果用人单位因员工请病假而扣除年终奖，且扣除金额不合理或规章制度中无相关规定，那么可能构成对员工合法权益的侵害。
- 特殊情形保护：对于处于医疗期内的员工，根据相关法律法规，用人单位在支付病假工资或疾病救济费的同时，不得大幅不合理地扣除年终奖。
实际操作中的建议：
- 了解规章制度：员工在请病假前应了解公司关于年终奖发放的相关规定，以避免不必要的纠纷。如果规章制度中未明确规定病假与年终奖的关系，员工有权要求公司按照法律法规和公平合理原则发放年终奖。
- 沟通协商：如果员工对年终奖扣除有异议，应与公司进行沟通协商，要求公司说明扣发依据。在沟通过程中，员工可以引用相关法律法规和规章制度来维护自己的合法权益。
- 法律途径维权：如果协商不成，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在维权过程中，员工需要提供相关证据来证明自己的主张，如病假证明、工资单、规章制度等。
总结来说，请病假扣年终奖是否合法，主要取决于用人单位的规章制度是否合法合理以及是否遵循了相关法律法规。员工在面临年终奖扣除问题时，应及时了解自己的权益和维权途径，必要时寻求法律帮助。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。