结论：合作合同中存在打卡约束和规章制度，且工资不是固定发放的情况下，判断该合同属于合作合同还是劳动合同，需要综合考虑多个因素，不能仅凭打卡约束、规章制度或工资发放形式单一判断。以下从不同角度进行分析：
一、合作合同与劳动合同的核心区别
合作合同：
- 通常基于双方平等、自愿的原则，共同完成某一项目或实现某一目标。
- 合作双方各自承担风险，共享收益，不存在雇佣与被雇佣的关系。
- 合作期限、合作内容、收益分配等通常由双方协商确定，灵活性较大。
劳动合同：
- 是劳动者与用人单位之间确立劳动关系，明确双方权利和义务的协议。
- 劳动者在用人单位的管理下提供劳动，用人单位支付劳动报酬。
- 劳动合同通常包含工作时间、工作地点、工资待遇、社会保险等条款，具有相对固定的模式。
二、打卡约束与规章制度的影响
- 打卡约束：虽然打卡约束通常与劳动关系相关联，但并非绝对。在合作合同中，如果双方约定了特定的合作时间或地点，并要求合作方按时到场或完成特定任务，也可能设置打卡约束。因此，打卡约束本身不足以判断合同性质。
- 规章制度：规章制度是用人单位管理劳动者的重要手段，但同样不是判断合同性质的唯一标准。在合作合同中，如果双方为了共同完成项目而制定了相应的规章制度，如工作流程、安全规范等，这些规章制度并不改变合作合同的本质。
三、工资发放形式的影响
- 非固定工资：非固定工资并不意味着一定是合作合同。在劳动合同中，工资也可以根据劳动者的工作表现、业绩等因素进行浮动。因此，工资发放形式不是判断合同性质的关键因素。
四、综合判断因素
在判断合作合同还是劳动合同时，应综合考虑以下因素：
- 双方关系：是否存在雇佣与被雇佣的关系，劳动者是否接受用人单位的管理和指挥。
- 工作内容：劳动者提供的工作是否属于用人单位业务组成部分，是否具有长期性、稳定性。
- 收益分配：双方是否按照约定共享收益，还是劳动者仅获取固定的劳动报酬。
- 风险承担：双方是否各自承担风险，还是主要由用人单位承担经营风险。
五、法律建议
- 审查合同条款：仔细审查合同条款，明确双方的权利和义务，特别是关于合作期限、合作内容、收益分配、风险承担等方面的约定。
- 收集证据：收集与合同履行相关的证据，如工作记录、工资发放记录、沟通记录等，以证明双方的实际关系。
- 咨询专业律师：如果对合同性质存在疑问或争议，建议咨询专业律师，以便根据具体情况提供法律意见和解决方案。
最后，合作合同与劳动合同的判断需要综合考虑多个因素，不能仅凭打卡约束、规章制度或工资发放形式单一判断。如果你对合同性质存在疑问或争议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供法律意见和解决方案。