关于事业单位是否保留农民合同制工人的集体经济组织成员身份，这并非一个由事业单位单方面决定的问题，而是需要结合具体情况和相关法律规定来综合判断。以下是从不同角度对此问题的分析：

1. 集体经济组织成员身份的认定：

   • 集体经济组织成员身份通常与户籍、土地承包关系、对集体资产的贡献等因素紧密相关。农民合同制工人若原本就是集体经济组织的成员，其身份不会因与事业单位签订劳动合同而自动丧失。
   • 然而，如果农民合同制工人在与事业单位签订劳动合同后，户籍发生了迁移（如从农村迁入城市），或者其土地承包关系发生了变更（如放弃了土地承包权），那么其集体经济组织成员身份可能会受到影响。

2. 事业单位与农民合同制工人的关系：

   • 事业单位与农民合同制工人之间签订的是劳动合同，这确立了双方之间的劳动关系。但劳动关系并不直接决定集体经济组织成员身份。
   • 事业单位在招聘农民合同制工人时，通常会考虑其户籍、技能等因素，但并不会直接涉及或改变其集体经济组织成员身份。

3. 相关法律法规的考量：

   • 根据《中华人民共和国农村土地承包法》等相关法律法规，农民作为集体经济组织成员，享有土地承包经营权等权益。这些权益的享有与是否签订劳动合同无关。
   • 同时，如果农民合同制工人在事业单位工作期间，其集体经济组织成员身份因某种原因受到质疑或挑战，他们可以依据相关法律法规来维护自己的权益。

4. 实际操作中的建议：

   • 对于农民合同制工人而言，如果他们关心自己的集体经济组织成员身份，建议在签订劳动合同前与事业单位明确沟通，并了解相关政策法规。
   • 如果在事业单位工作期间遇到集体经济组织成员身份相关的问题，可以及时向当地农村土地承包管理部门或相关法律机构咨询，以维护自己的合法权益。

总结来说，事业单位与农民合同制工人签订劳动合同，并不直接决定或改变其集体经济组织成员身份。这一身份的认定需要综合考虑户籍、土地承包关系、对集体资产的贡献等多种因素。如果有任何疑问或遇到相关问题，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。