针对您提出的“豆芽赤霉素超标怎么处罚”的问题，这主要涉及到食品安全法规以及市场监管部门的行政处罚措施。以下是我根据相关法规和实际案例，为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，豆芽中赤霉素超标是违反食品安全法规的行为。根据《中华人民共和国食品安全法》以及国家食品药品监督管理总局、农业部、国家卫生和计划生育委员会联合发布的公告，豆芽生产过程中是禁止使用赤霉素等物质的。因此，一旦豆芽被检测出赤霉素超标，生产者或经营者将面临法律处罚。
关于处罚的具体措施，这通常取决于多个因素，包括违法行为的性质、情节、后果以及当事人的配合程度等。一般来说，市场监管部门会依据《中华人民共和国食品安全法》的相关规定，对违法者进行以下处罚：
没收违法所得：即没收因销售不合格豆芽所获得的全部收入。
没收违法生产经营的食品：包括不合格的豆芽以及可能用于生产这些豆芽的原料、工具、设备等。
罚款：根据违法生产经营的食品货值金额的大小，罚款的数额也会有所不同。货值金额不足一万元的，通常并处五万元以上十万元以下罚款；货值金额一万元以上的，则并处货值金额十倍以上二十倍以下罚款。不过，在实际执法中，如果当事人能积极配合调查、主动提供证据材料，且违法情节较轻、未造成严重后果的，市场监管部门可能会依法从轻或减轻处罚。
情节严重的，吊销许可证：如果当事人的违法行为情节严重，如多次违法、造成严重食品安全事故等，市场监管部门还有权吊销其食品生产经营许可证。
以您提供的两个案例为例：
在东兴市的案例中，当事人因销售赤霉素超标的豆芽被没收违法所得600元，并因情节较轻被减轻处罚，最终合计罚没3600元。
在南江县的案例中，当事人因销售含有4-氯苯氧乙酸钠（与赤霉素同属禁止使用物质）的不合格豆芽，虽然仅获利12元，但因无法提供进货资质和检验报告等证照票据，被处以50000元的罚款。
这两个案例都表明，市场监管部门对豆芽等食品中的非法添加物持零容忍态度，并将依法对违法者进行严厉处罚。
因此，我建议您如果涉及豆芽生产或经营，务必严格遵守食品安全法规，确保豆芽中不含有任何非法添加物。如果一旦发现豆芽赤霉素超标等问题，应立即停止销售并主动配合市场监管部门的调查和处理工作，以减轻可能的法律后果。