结论：事业单位职工在40年工龄、60岁时被判监外执行2年，刑期满后是否可以办理退休，需根据具体情况判断，但一般情况下，只要满足退休条件，刑期满后是可以办理退休的。

分析说明：

1. 退休条件：

   • 根据相关规定，事业单位职工退休通常需要满足一定的年龄和工龄条件。在此案例中，职工已经60岁且拥有40年工龄，从年龄和工龄上看，已经满足了退休的基本条件。

2. 监外执行对退休的影响：

   • 监外执行是一种刑罚执行方式，它并不改变罪犯的刑事身份，但允许罪犯在监狱外服刑。重要的是，监外执行期间，罪犯仍然享有一定的权利，包括在符合条件时申请退休。
   • 监外执行本身并不直接剥夺职工的退休权利。只要职工在监外执行期间没有违反相关规定，且刑期满后没有其他影响退休的法定事由（如仍在服刑、被剥夺政治权利等），那么他们就有权申请退休。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 退休申请流程：职工需要按照事业单位的退休申请流程，提交相关材料，包括个人身份证明、工龄证明、退休申请表等。
   • 审核与批准：事业单位和相关部门会对职工的退休申请进行审核，确认其是否满足退休条件。如果职工在监外执行期间表现良好，且刑期满后没有其他问题，那么他们的退休申请很可能会得到批准。
   • 养老金领取：一旦退休申请得到批准，职工就可以开始领取养老金。养老金的数额会根据职工的工龄、工资水平等因素确定。

特殊情况说明：

• 如果职工在监外执行期间有严重违反规定的行为，或者刑期满后仍有其他影响退休的法定事由（如仍在服刑、被剥夺政治权利等），那么他们的退休申请可能会被拒绝。
• 另外，如果职工所在的事业单位有特殊的退休政策或规定，那么也需要按照这些政策或规定来执行。

建议：

• 如果您或您身边的人遇到类似情况，建议首先咨询所在事业单位的人事部门或相关部门，了解具体的退休政策和申请流程。
• 同时，也可以咨询我，我会根据您的具体情况，提供更详细的法律建议和指导。