关于政府土地如何作价出资合法的问题，这是一个涉及多个法律环节和步骤的复杂过程。以下是我为您梳理的详细流程及法律要点解析：
一、前期决策与准备阶段
进行可行性研究：
- 在决定以土地使用权作价出资前，需全面评估此举的必要性、市场前景、经济效益以及技术可行性。例如，若计划用于商业开发，需调研该区域的人流量、租金收益等关键指标。
履行内部决策程序：
- 根据公司章程及相关法律法规，召开董事会或股东会（对于股份有限公司则是股东大会），明确出资方式、金额、股权比例等关键事项，并形成决议。
确定土地价值：
- 聘请有资质的专业评估机构，采用市场比较法、收益还原法、成本逼近法等合适方法，对土地使用权进行客观、公正的价值评估，并出具正式的评估报告。
准备相关资料：
- 整理土地使用权证、作价出资协议或合同草案、公司章程、股东会决议、评估报告等必要文件，为后续手续办理做好准备。
二、签订出资协议与办理变更手续阶段
签订出资协议：
- 与其他出资方签订详细的土地使用权作价出资协议，明确双方的权利义务，包括土地的基本情况、作价金额、出资方式、股权比例、交付时间、违约责任等关键条款。
修改公司章程：
- 若向公司出资，需在公司章程中明确记载土地使用权的出资情况，并相应修改注册资本和股东名册，确保公司章程与实际情况一致。
申请土地变更登记：
- 向土地所在地的国土资源管理部门提交土地变更登记申请书、土地使用证、出资协议等相关文件，办理土地使用权变更登记手续，将土地使用权转移至新设企业或已有企业名下。
工商变更登记：
- 若是向已有公司出资，还需到工商行政管理部门办理注册资本变更、股东变更等工商变更登记手续，确保公司登记信息与实际情况相符。
三、后续事项处理阶段
产权登记与备案：
- 完成土地变更登记后，到相关部门办理产权登记，将土地使用权正式纳入企业资产范畴，并根据规定向工商行政管理部门等备案，确保企业资产的合法性和准确性。
税务处理：
- 土地使用权作价出资涉及增值税、土地增值税、企业所得税、契税等多种税费。企业应咨询当地税务机关，了解具体税务政策和申报要求，确保税务处理合规，及时申报缴纳相关税费。
其他相关手续：
- 根据具体情况，可能还需办理环保审批、规划许可等其他相关手续。企业应密切关注相关政策法规的变化，确保所有手续都符合法律法规的要求。
总结与建议：
土地使用权作价出资是一个复杂且涉及多个法律环节的过程。企业在操作前应充分了解相关法律法规和政策要求，做好充分的前期准备和决策工作。同时，建议咨询专业的律师或中介机构，以获得专业的法律指导和支持，降低潜在的法律风险和经济纠纷。通过遵循上述流程和法律要点，您可以确保政府土地作价出资的合法性和准确性。