工人申请劳动仲裁的过程中是可以进行协商的。以下从不同角度为你详细分析：

协商的法律依据与合理性

根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，劳动争议发生后，当事人可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解；调解不成，当事人一方要求仲裁的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。这里虽然没有直接提及“协商”，但调解本质上就是一种协商的过程，旨在通过双方自愿、平等的沟通，达成和解协议，从而解决劳动争议。因此，从法律精神和实践操作来看，协商是解决劳动争议的一种重要方式，且贯穿于劳动争议处理的始终。

协商的时机与方式

1. 申请仲裁前：在工人决定申请劳动仲裁之前，可以尝试与用人单位进行协商，看是否能够就争议事项达成一致意见。这种方式成本较低，效率较高，有助于维护双方的和谐关系。
2. 申请仲裁后：即使工人已经向劳动争议仲裁委员会提交了仲裁申请，也不妨碍双方在仲裁过程中继续进行协商。实际上，仲裁机构在受理案件后，通常会鼓励双方进行调解，以促成和解。如果双方能够达成和解协议，工人可以撤回仲裁申请，或者仲裁机构可以根据和解协议制作调解书，该调解书与仲裁裁决具有同等法律效力。

协商的注意事项

1. 自愿平等：协商应当基于双方自愿、平等的原则进行，任何一方都不得强迫对方接受不合理的条件。
2. 合法合规：协商的内容应当符合法律法规的规定，不得违反公序良俗或者损害国家、社会公共利益。
3. 书面记录：为了保障双方的权益，协商过程中最好形成书面记录，明确双方的权利义务和协商结果。如果达成和解协议，应当签订书面和解协议，并由双方签字或者盖章确认。

协商不成后的处理

如果双方协商不成，或者协商后一方不履行和解协议，工人可以继续向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁机构将依法对案件进行审理，并作出裁决。如果工人对仲裁裁决不服，还可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。

温馨提示：在协商过程中，如果工人对法律条款、协商技巧等方面存在疑问，或者担心自己的权益得不到保障，可以随时向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议和帮助。