结论：当主管部门在履行职责过程中已涉法时，应当根据具体情况采取相应的法律措施，包括但不限于配合司法机关调查、依法行使职权、寻求法律救济等。以下是对此问题的详细分析：

一、配合司法机关调查

1. 法律义务：主管部门在履行职责过程中，如果涉及法律诉讼或调查，有义务配合司法机关的工作，提供必要的文件和资料，协助查明事实真相。
2. 实际操作：主管部门应设立专门的法律事务部门或指定专人负责与司法机关的沟通，确保信息的准确传递和及时反馈。同时，应建立完善的档案管理制度，以便在需要时能够迅速提供相关证据材料。

二、依法行使职权

1. 法律授权：主管部门在履行职责时，应严格依据法律法规的授权进行，不得超越职权范围或滥用职权。
2. 决策程序：在涉及法律问题的决策过程中，主管部门应遵循法定程序，确保决策的合法性和合理性。例如，在作出行政处罚决定前，应依法告知当事人享有陈述、申辩等权利，并听取其意见。

三、寻求法律救济

1. 行政复议：如果主管部门认为司法机关的裁决或决定侵犯了其合法权益，可以依法申请行政复议，通过上级行政机关的审查来维护自身权益。
2. 行政诉讼：在行政复议无法解决问题的情况下，主管部门还可以依法向人民法院提起行政诉讼，通过司法途径来维护自身权益。
3. 其他法律途径：根据具体情况，主管部门还可以考虑通过协商、调解等其他法律途径来解决涉法问题。

四、加强内部法律培训

1. 提升法律意识：主管部门应定期组织内部法律培训，提高员工的法律意识和法律素养，确保在履行职责过程中能够依法行事。
2. 专业法律支持：对于复杂的法律问题，主管部门可以聘请专业律师提供法律咨询和法律服务，以确保决策的合法性和有效性。

五、案例参考与风险防范

1. 案例参考：主管部门可以借鉴类似案例的处理方式和经验，为自身涉法问题的处理提供参考和借鉴。
2. 风险防范：在履行职责过程中，主管部门应建立健全风险防范机制，及时发现和纠正可能存在的法律风险点，避免涉法问题的发生。

建议：面对涉法问题，主管部门应保持冷静和理性，积极配合司法机关的工作，依法行使职权，并寻求必要的法律救济。同时，加强内部法律培训和风险防范工作也是必不可少的。如果您在具体操作中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。