肯德基员工是否会因以漏件理由退款而被罚款，需分情况讨论：

1. 若漏件情况属实且员工无过错
   若因生产、包装环节的疏漏导致漏件（如厨房未装入某样小食、包装时遗漏配件），且员工在接单、配餐过程中已尽到合理注意义务（如核对订单、检查餐品），则员工通常无需承担罚款责任。此时退款属于商家对消费者的合理补偿，责任应由企业承担（如通过内部质量管控流程改进），而非转嫁至一线员工。

2. 若漏件因员工故意或重大过失导致
   若员工存在故意漏装（如私自扣留餐品部件）、严重疏忽（如未核对订单即交付）等行为，且该行为直接导致退款发生，企业可能依据内部规章制度对员工进行处罚，包括但不限于警告、扣减绩效、罚款等。但需注意：

   • 罚款合法性：根据《劳动合同法》及相关地方规定，企业罚款需符合法定条件（如员工行为造成直接经济损失、罚款金额不超过月工资20%等），且需在劳动合同或规章制度中明确约定。若企业未履行民主程序制定规则或罚款超出法定限度，员工可主张处罚无效。
     
   • 举证责任：企业需证明漏件与员工行为之间的直接因果关系（如监控录像、订单核对记录等），否则可能面临劳动仲裁败诉风险。

3. 若退款系消费者恶意索赔或误判
   若消费者以虚假理由（如声称漏件但实际未发生）要求退款，且员工已尽到核实义务（如检查餐品、调取监控），则员工不仅无需担责，企业还应通过法律途径追究消费者欺诈责任（如要求返还退款、赔偿损失）。此时员工可能因妥善处理纠纷获得企业奖励。

建议：

• 对企业：应完善内部质量管控流程（如双重核对机制），明确退款责任划分标准，避免随意处罚员工；若需罚款，需确保制度合法且程序合规。
  
• 对员工：若因漏件被处罚，可要求企业出示证据并核对处罚依据；若认为处罚违法，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
  

如有进一步细节（如企业具体处罚规定、漏件原因证据等），可提供更多信息以便更精准分析。