结论：雇主起诉司机因不配合违章扣分的问题，法院的判决会依据具体情况而定，但通常可能涉及合同违约、侵权责任或劳动纪律等方面的考量。以下是对此问题的详细分析：

1. 合同违约角度：

   • 如果雇主与司机之间签订了明确的雇佣合同，并且合同中规定了司机需遵守交通规则、配合处理违章等条款，那么司机不配合扣分可能构成违约。
   • 在此情况下，雇主可以依据合同条款向法院提起诉讼，要求司机承担违约责任，如赔偿因违章产生的罚款、滞纳金以及因司机不配合导致的额外损失等。
   • 法院在判决时，会审查合同的具体条款、司机的违约行为以及雇主因此遭受的损失，从而确定司机应承担的赔偿责任。

2. 侵权责任角度：

   • 如果司机的不配合行为导致雇主遭受了实际损失（如车辆被扣、无法正常运营等），并且这种损失与司机的不配合行为之间存在因果关系，那么雇主也可以从侵权责任的角度向法院提起诉讼。
   • 在侵权责任诉讼中，雇主需要证明司机的不配合行为构成了侵权，即违反了法律规定的义务或合同约定的义务，并且这种行为导致了雇主的损失。
   • 法院在判决时，会综合考虑双方的行为、过错程度以及损失情况，来确定司机是否应承担侵权责任以及赔偿的具体数额。

3. 劳动纪律角度（如司机为雇员）：

   • 如果司机是雇主的雇员，并且雇主有明确的劳动纪律或规章制度规定了员工需遵守交通规则、配合处理违章等，那么司机不配合扣分可能违反了劳动纪律。
   • 在此情况下，雇主可以依据劳动纪律或规章制度对司机进行处罚，如警告、罚款、解除劳动合同等。如果司机对处罚不服，双方可能因此产生劳动争议。
   • 如果劳动争议无法通过协商解决，雇主或司机可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁结果不服的，还可以向法院提起诉讼。法院在判决时，会审查劳动纪律或规章制度的合法性、司机的违纪行为以及雇主的处罚措施是否合理等。

法律建议：

• 雇主在与司机签订雇佣合同时，应明确约定司机需遵守交通规则、配合处理违章等条款，并规定相应的违约责任和赔偿方式。
• 雇主应建立健全的劳动纪律或规章制度，明确员工需遵守的交通规则和违章处理流程，以便在发生争议时有据可依。
• 在发生司机不配合扣分的情况时，雇主应首先尝试与司机进行协商，寻求和解或达成补偿协议。如果协商无果，再考虑通过法律途径解决争议。

可能的法律后果：

• 如果法院认定司机构成违约或侵权，司机可能需要承担赔偿责任，包括赔偿雇主因违章产生的罚款、滞纳金以及因司机不配合导致的额外损失等。
• 如果司机是雇员且违反了劳动纪律或规章制度，雇主可能依据规定对司机进行处罚，如警告、罚款、解除劳动合同等。但雇主在处罚时需确保处罚措施合法合理，避免引发劳动争议。

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