施工单位不配合处理农民工欠薪问题，可通过以下途径解决：

1. 向劳动监察部门投诉
   根据《劳动保障监察条例》第十一条，劳动保障行政部门对用人单位支付工资的行为负有监察职责。农民工可携带劳动合同、工资条、考勤记录等证据，向施工单位所在地的劳动监察大队提交书面投诉材料。劳动监察部门有权责令施工单位限期支付工资，逾期不支付的可按应付金额50%-100%加付赔偿金。

2. 申请劳动仲裁
   若存在劳动关系争议（如未签劳动合同），可依据《劳动争议调解仲裁法》向劳动合同履行地或用人单位所在地的劳动仲裁委员会申请仲裁。仲裁时效为知道或应当知道权利被侵害之日起1年内，需提交仲裁申请书、身份证明及证据材料。仲裁裁决具有法律效力，施工单位拒不履行的可申请法院强制执行。

3. 通过行业主管部门协调
   若施工单位为建筑企业，可向当地住建部门反映情况。根据《保障农民工工资支付条例》第四十三条，住建部门对建设领域欠薪问题有专项监管职责，可通过约谈企业负责人、限制市场准入等措施督促整改。

4. 刑事报案（涉嫌拒不支付劳动报酬罪）
   若施工单位以转移财产、逃匿等方法逃避支付工资，或有能力支付而拒不支付，数额较大（通常为5000元至3万元以上），经政府有关部门责令支付仍不支付的，可依据《刑法》第二百七十六条之一向公安机关报案，追究直接责任人员刑事责任。

5. 法律援助与诉讼支持
   符合条件的农民工可向当地法律援助机构申请免费法律服务，由律师协助收集证据、起草法律文书并参与诉讼。若对仲裁裁决不服，可在收到裁决书15日内向法院提起民事诉讼，要求支付工资及经济补偿。

操作建议：

• 优先通过劳动监察部门快速处理，同步收集证据（如工资确认单、工友证言等）；
  
• 若涉及工程款纠纷导致欠薪，可要求建设单位或总承包单位先行清偿（依据《保障农民工工资支付条例》第三十条）；
  
• 群体性欠薪案件可推选代表处理，提高维权效率。
  

如需进一步分析具体证据或程序细节，可直接向我咨询。