针对您提出的“某员工已累计旷工两次怎么处理”的问题，这确实是一个涉及公司规章制度和劳动法的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，员工旷工是违反公司规章制度和劳动纪律的行为。对于累计旷工两次的员工，公司应当依据既定的规章制度和劳动合同中的相关条款进行处理。
一、审查公司规章制度
- 规章制度内容：公司应首先审查其规章制度中关于旷工的具体规定，包括旷工的定义、旷工的次数与后果、处理程序等。
- 规章制度合法性：确保规章制度的内容合法、合理，且已经过民主程序制定并公示，以便在处理员工旷工问题时具有法律效力。
二、核实旷工事实
- 考勤记录：公司应核实员工的考勤记录，确认其确实存在旷工行为，并记录旷工的具体日期和时长。
- 员工沟通：在处理前，公司可以与员工进行沟通，了解其旷工的原因和情况，以便更全面地评估问题。
三、依据规章制度处理
- 警告或记过：对于累计旷工两次的员工，公司可以根据规章制度给予警告或记过等纪律处分，以示警戒。
- 解除劳动合同：如果规章制度中明确规定累计旷工达到一定次数（如两次或更多）可以解除劳动合同，且该规定合法有效，那么公司在符合法定程序的情况下可以解除与该员工的劳动合同。但需要注意的是，解除劳动合同应当遵循合理、善意的原则，并确保程序合法。
四、考虑特殊情况
- 员工解释：如果员工能够提供合理的解释或证明其旷工行为有正当理由（如突发疾病、家庭紧急情况等），公司应予以考虑，并可能根据实际情况调整处理措施。
- 人性化处理：在处理员工旷工问题时，公司也应考虑人性化因素，如员工的工作表现、对公司的贡献等，以便更公正、合理地处理问题。
五、法律风险防范
- 合法解除：如果公司决定解除与员工的劳动合同，应确保解除行为合法有效，避免引发劳动争议或法律诉讼。
- 证据保留：公司应妥善保留与员工旷工相关的证据，如考勤记录、沟通记录等，以便在需要时提供证明。
六、实际案例参考
以您提供的案例为例，第一个案例中员工因出差返回时间问题被公司认定为旷工并解除劳动合同，但法院最终认定公司解除行为违法，因为公司规章制度中并未明确规定此类行为属于旷工。第二个案例中员工因行政拘留未到岗工作被公司认定为旷工并解除劳动合同，法院则支持了公司的解除行为，因为员工未经正常请假程序且未到岗工作理由不正当。
综上所述，对于累计旷工两次的员工，公司应依据规章制度进行合法、合理的处理，并考虑特殊情况、防范法律风险。在处理过程中，公司应保持与员工的沟通，确保处理措施的公正性和合理性。