结论前置：未在中标通知书发出之日起30日内签订合同，双方是可以协商的，但需遵循一定的法律原则和程序。
一、法律原则与规定
根据《中华人民共和国招标投标法》第四十六条的规定：“招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起三十日内，按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同。招标人和中标人不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。”这一规定明确了签订合同的期限和基本要求，即双方应在中标通知书发出后的30天内签订书面合同。然而，法律并未绝对禁止双方在此期限后进行协商或签订合同，只是强调了在此期限内签订合同的重要性。
二、双方协商的可能性与条件
双方协商一致：
- 如果双方因特殊原因（如内部决策流程、资金安排等）无法在中标通知书发出后的30天内签订合同，但双方均愿意继续合作，那么他们可以通过协商一致的方式，延长签订合同的期限。
- 协商过程中，双方应明确新的签订时间、合同内容以及其他相关事项，并最好以书面形式记录下来，以避免后续纠纷。
不可抗力等特殊情况：
- 如果因不可抗力事件（如自然灾害、政府征收等）导致无法按时签订合同，双方可以根据实际情况推迟签订，并及时通知对方、提供相应证明。
- 在这种情况下，双方应重新协商确定签订时间，并确保合同内容符合法律法规和招标文件的要求。
三、协商过程中的注意事项
保留证据：
- 在协商过程中，双方应妥善保存相关证据，如邮件、短信、通话记录等，以备不时之需。这些证据可以证明双方协商的过程和结果，有助于解决后续可能出现的纠纷。
遵守法律法规：
- 无论双方如何协商，都必须遵守相关法律法规和招标文件的要求。不得订立背离合同实质性内容的其他协议，以确保合同的公平性和有效性。
及时沟通：
- 双方应保持密切沟通，确保在协商过程中及时解决问题和分歧。通过及时沟通，可以避免因信息不对称或误解而导致的纠纷。
四、法律后果与风险
违约责任：
- 如果一方未能在规定时间内签订合同，且未与对方协商一致或未提供不可抗力等合法理由，那么另一方有权要求其承担违约责任。这可能包括支付违约金、赔偿损失等法律后果。
项目延误或取消：
- 如果因双方未能及时签订合同而导致项目延误或取消，那么双方都可能面临经济损失和信誉损失。因此，双方应高度重视合同签订的时间问题，并尽力避免因此导致的纠纷。
建议：在实际操作中，如果双方因特殊原因无法在中标通知书发出后的30天内签订合同，建议尽快与对方进行沟通协商，并明确新的签订时间和合同内容。同时，双方应保留好相关证据，以备不时之需。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。