如果合同条款中备注的部分对方后面不承认，你可以采取以下措施来维护自己的权益：
核查合同原件及备份：
- 首先，仔细核查你手中的合同原件，确认备注部分是否确实存在，并且是否有双方的签字或盖章确认。
- 同时，检查是否有合同的备份或扫描件，这些也可以作为证据来支持你的主张。
收集其他相关证据：
- 如果合同原件或备份中的备注部分不够清晰或存在争议，你可以尝试收集其他相关证据来证明备注内容的真实性。
- 例如，你可以查找与合同相关的邮件、短信、聊天记录等，这些通信记录中可能包含了双方对备注内容的确认或讨论。
- 另外，如果有第三方见证人或中介机构参与合同的签订过程，他们的证言或书面证明也可以作为有力证据。
与对方协商沟通：
- 在收集到足够证据后，你可以尝试与对方进行协商沟通，明确表达你的立场和诉求。
- 通过友好协商，有时可以达成双方都能接受的解决方案，避免进一步的法律纠纷。
寻求法律途径解决：
- 如果协商沟通无果，你可以考虑通过法律途径来解决争议。
- 你可以向法院提起诉讼，要求确认合同备注部分的效力，并追究对方的违约责任。
- 在诉讼过程中，你需要提交充分的证据来支持你的主张，包括合同原件、备份、相关通信记录、证人证言等。
- 法院将根据事实和法律规定来作出判决，维护你的合法权益。
在处理此类纠纷时，你还需要注意以下几点：
- 保留证据的重要性：在整个过程中，保留所有与合同相关的证据至关重要。这些证据将是你维护自己权益的有力武器。
- 法律程序的复杂性：法律程序可能相对复杂且耗时较长，因此你需要做好充分的准备和耐心。如果可能的话，你可以寻求专业律师的帮助来指导你处理整个过程。
- 和解的可能性：在诉讼过程中或之前，双方都有可能达成和解协议。和解可以是一种更快速、更经济的解决方式，因此你可以考虑在适当的时候提出和解建议。
最后，我建议你根据具体情况评估上述措施的适用性，并选择最适合你的方式来处理合同纠纷。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。