公司以职工违规为由扣款是否违法，不能一概而论，需要分情况讨论：

1. 如果公司扣款有明确的规章制度依据，且该规章制度合法有效：

   • 根据《劳动合同法》及相关法律法规，公司有权制定合理的规章制度来管理员工，包括对违规行为的处罚措施。如果公司的规章制度中明确规定了员工违规时可以扣款，并且该规章制度已经通过民主程序制定、公示或告知了员工，同时内容不违反法律、行政法规及政策规定，那么公司依据该规章制度对员工进行扣款，通常是合法的。
   • 举例：假设公司规章制度中规定，员工迟到一次扣款50元，且该规定已经通过职工代表大会讨论通过，并公示在公司的公告栏上。那么，当员工迟到时，公司依据该规定扣款50元，就是合法的。

2. 如果公司扣款没有明确的规章制度依据，或者规章制度违法：

   • 如果公司没有制定相关的规章制度，或者规章制度没有经过民主程序制定、未公示或告知员工，或者规章制度的内容违反法律、行政法规及政策规定，那么公司以职工违规为由扣款就是违法的。
   • 举例：假设公司没有制定任何关于员工违规扣款的规章制度，却突然以员工工作失误为由扣款200元。这种情况下，公司的扣款行为就是违法的，因为缺乏合法的规章制度依据。
   • 另外，即使公司有规章制度，但如果规章制度中规定的扣款金额过高，或者扣款方式不合理，也可能被认定为违法。比如，规章制度中规定员工一次违规就扣除全部工资，这种规定显然是不合理的，也是违法的。

3. 关于扣款金额的限制：

   • 即使公司扣款有合法的规章制度依据，扣款金额也受到一定限制。根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
   • 举例：假设员工当月工资为5000元，因违规给公司造成经济损失，公司依据规章制度要求员工赔偿。那么，公司每月最多只能从员工工资中扣除1000元（即5000元的20%）作为赔偿。如果扣除1000元后，员工剩余工资仍高于当地最低工资标准，那么这种扣款就是合法的；如果扣除后员工剩余工资低于当地最低工资标准，那么公司只能扣除至最低工资标准，剩余部分需另行安排赔偿。

法律建议：

• 作为员工，如果公司以违规为由扣款，首先要查看公司的规章制度是否合法有效，以及扣款金额是否合理。如果认为公司的扣款行为违法或不合理，可以与公司协商解决，或者向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等。
• 作为公司，在制定规章制度时，要确保规章制度合法有效，并明确规定员工违规时的处罚措施和扣款金额。同时，在执行扣款时，要遵守相关法律法规的规定，确保扣款金额合理、合法。

可能后果：

• 如果公司违法扣款，员工有权要求公司返还被扣的工资，并可能要求公司支付赔偿金。同时，公司还可能面临劳动监察部门的处罚和劳动争议仲裁或诉讼的风险。
• 如果员工认为公司扣款合法但金额过高或方式不合理，也可以通过法律途径维护自己的合法权益。