工作中被公司扣款是否违法，需根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细分析：
合法扣款的情形：
- 法定代扣代缴：如个人所得税、社保费用等，公司依据法律法规从员工工资中代扣代缴是合法的。
- 公司规章制度扣款：若公司规章制度经过民主程序制定，内容合法，且已向员工公示，则在员工违反规章制度时，公司可按规定扣款。
- 经济损失赔偿：员工因个人原因给公司造成经济损失，公司可要求赔偿，并从其工资中扣除，但扣除额有限制。
- 绩效不达标扣款：如绩效考核制度公平、公正，并明确规定了绩效不达标的扣减措施，公司可合法扣减绩效工资。
违法扣款的情形：
- 无故克扣工资：公司无任何正当理由随意扣减员工工资，即构成违法。
- 克扣工资作为惩罚手段：公司以罚款等形式扣减员工工资作为对一般性违纪行为的惩罚，且缺乏法律依据，属于违法行为。
- 扣款比例过高或低于最低工资标准：公司扣款时超过法定比例，或扣除后剩余工资低于当地月最低工资标准，均属违法。
- 未按规定支付工资：公司未按照劳动合同及国家规定足额发放工资报酬，也构成违法。
因此，判断公司扣款是否违法，需综合考虑扣款的原因、依据、比例以及是否违反法律法规和公司规章制度等因素。如员工认为公司扣款行为违法，可与公司协商，或向劳动监察大队投诉，甚至申请劳动仲裁来维护自身权益。如有具体疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。