工作中被扣钱是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从多个角度为你详细分析：
一、合法扣钱的情形
法定扣款：
- 根据《中华人民共和国个人所得税法》等相关法律法规，用人单位需依法代扣代缴员工的个人所得税、社会保险费等法定费用。这些扣款是合法的，且员工有义务配合。
约定扣款：
- 如果用人单位与员工在劳动合同或规章制度中明确约定了扣款事项，如因员工违反公司规定、造成经济损失等而需承担的赔偿责任，且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位在符合约定条件的情况下扣款是合法的。
法院判决或仲裁裁决扣款：
- 在劳动争议案件中，如果法院判决或劳动仲裁裁决员工需向用人单位支付一定金额的赔偿或费用，那么用人单位根据生效的法律文书扣款也是合法的。
二、非法扣钱的情形
无故克扣工资：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。如果用人单位无正当理由扣减员工工资，如仅因员工未打卡、迟到几分钟等轻微违规行为就扣减大量工资，这种行为通常是不合法的。
超出约定或法定范围的扣款：
- 即使劳动合同或规章制度中约定了扣款事项，但如果用人单位扣款的金额超出了约定或法定的范围，或者扣款的理由不充分、不合理，那么这种扣款也是不合法的。
未履行告知义务：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位在制定涉及劳动者切身利益的规章制度时，应经过民主程序，并与工会或职工代表平等协商确定，同时需公示或告知劳动者。如果用人单位未履行这些告知义务就擅自扣款，员工有权拒绝并主张自己的合法权益。
三、维权途径
与公司沟通协商：
- 如果员工认为用人单位的扣款行为不合法或不合理，可以先与公司进行沟通协商，尝试解决问题。
向劳动监察部门投诉：
- 如果沟通协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉用人单位的违法行为。劳动监察部门会依法进行调查处理，并维护员工的合法权益。
申请劳动仲裁：
- 如果劳动监察部门的处理结果不能满足员工的需求，员工还可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁。劳动仲裁机构会依法进行裁决，并保障员工的合法权益得到实现。
举例说明：假设某员工因一次未打卡被公司扣除了整天的工资，而该员工实际上已经正常出勤并完成了工作任务。在这种情况下，公司的扣款行为很可能是不合法的，因为打卡仅是考勤管理的一种方式，并非判定出勤的唯一标准。员工可以先与公司沟通协商，要求公司支付应得的工资；如果协商无果，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
总结与建议：工作中被扣钱是否合法需根据具体情况判断。如果员工认为用人单位的扣款行为不合法或不合理，建议先与公司沟通协商；如果无法解决问题，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。