结论前置：考核没有满100分，公司从工资中倒扣的做法是否合理，需分情况讨论，一般情况下，若劳动合同或公司规章制度中无明确约定，则从工资中倒扣的做法是不合理的。以下是对此问题的详细分析：
一、劳动合同与规章制度的角度
劳动合同约定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同应当明确约定劳动报酬、工作时间、休息休假等事项。若劳动合同中明确约定了考核制度及未达标时的工资扣减条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照约定从工资中扣减部分金额可能是合法的。
- 但，若劳动合同中未明确约定此类条款，公司则无权单方面决定从工资中扣减。
公司规章制度：
- 公司规章制度是公司内部管理的重要依据，但同样需要遵守法律法规的规定。若公司规章制度中规定了考核制度及未达标时的工资扣减措施，且该规章制度已经过民主程序制定、公示或告知劳动者，那么该规章制度对劳动者具有约束力。
- 然而，即便规章制度中有此规定，也需确保该规定不违反法律法规的强制性规定，如不得低于最低工资标准等。
二、法律法规的角度
最低工资标准：
- 根据《中华人民共和国劳动法》的规定，劳动者在法定工作时间内提供了正常劳动的，用人单位应支付的工资不得低于当地的最低工资标准。若公司从工资中扣减的金额导致劳动者的实际工资低于最低工资标准，则该扣减行为是违法的。
工资支付规定：
- 《工资支付暂行规定》等法规也明确了工资支付的原则和方式，包括工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资等。若公司无正当理由从工资中扣减，可能构成克扣工资的行为。
三、实际操作与建议
审查劳动合同与规章制度：
- 劳动者应首先审查自己的劳动合同和公司的规章制度，看是否有关于考核未达标时工资扣减的明确约定或规定。
与公司沟通协商：
- 若发现公司存在不合理的工资扣减行为，劳动者可以与公司进行沟通协商，要求公司说明扣减的依据和合理性，并寻求解决方案。
寻求法律援助：
- 若沟通协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。在此过程中，建议劳动者保留好相关证据，如工资条、考核记录、劳动合同等。
举例说明：假设某公司规章制度中规定，员工考核未达标时，将从工资中扣减一定比例的金额作为惩罚。但该规章制度未经民主程序制定且未公示或告知劳动者，同时扣减后的工资低于当地最低工资标准。在此情况下，公司从工资中倒扣的做法就是不合法的，劳动者有权拒绝并寻求法律援助。
最后建议：若您遇到类似情况，请务必先审查自己的劳动合同和公司规章制度，了解公司的考核制度和工资扣减规定。如有疑问或发现不合理之处，请及时与公司沟通协商或寻求法律援助。有问题可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。