结论：月平均工资8000元但社保基数按9000元缴纳是否合法，需分情况讨论，可能合法也可能不合法，具体取决于社保基数的确定规则及双方约定情况。以下从不同角度展开分析：

1. 若社保基数按实际工资申报且符合当地规定，则合法

根据《社会保险法》及地方社保政策，社保基数通常以职工上年度月平均工资为基准确定，但需同时满足当地规定的上下限标准（如当地上年度社平工资的60%-300%）。

• 合法情形：若当地上年度社平工资的60%≤9000元≤300%，且公司按实际工资8000元申报时，因某种原因（如系统调整、补缴差额等）最终基数确定为9000元，且双方协商一致或符合政策调整规则（如补缴历史欠费），则可能合法。
  
• 关键点：需核实当地社保基数上下限，并确认公司是否履行了告知义务（如通过工资条、劳动合同补充条款等明确基数调整原因）。

2. 若社保基数高于实际工资且无合法依据，则不合法

若公司单方面将社保基数从8000元提高至9000元，且未满足以下条件，则可能违法：

• 无政策依据：当地社保基数下限高于8000元（如下限为8500元），但公司直接按9000元缴纳，需确认是否符合“就高不就低”原则（部分地区允许按实际工资或更高基数缴纳，但需自愿）。
  
• 未协商一致：若公司未与员工协商，擅自提高基数导致员工到手工资减少（如个人需多缴社保费），可能侵犯员工知情权和协商权。
  
• 规避责任：若公司为减少单位缴费比例（如按高基数缴纳可降低某些附加费率），但未实际支付对应工资，可能涉嫌通过虚假基数逃避社保责任。

3. 员工如何维权？

若怀疑公司社保基数不合法，可采取以下步骤：

1. 核实当地政策：通过社保局官网或12333热线查询当地上年度社平工资及基数上下限。
   
2. 要求公司说明：向HR或财务部门索要社保缴费明细及基数计算依据，确认是否与工资匹配。
   
3. 投诉举报：若公司存在违规，可向当地社保稽核部门投诉（需提供劳动合同、工资流水等证据）。
   
4. 劳动仲裁：若因基数问题导致权益受损（如影响养老金、医保待遇），可申请劳动仲裁要求补缴差额。

温馨提示：社保基数直接影响未来养老、医疗等权益，建议定期核对缴费记录。如有疑问，可直接向我咨询具体操作流程或政策解读。