结论：老板要求中途离职的员工三个月内结清工资，这一做法是否违法，需根据具体情况判断。若劳动合同或公司规章制度中有明确约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则可能合法；但若无约定或约定违反法律法规，则老板的做法违法。

分析：

1. 劳动合同或公司规章制度中的约定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。若劳动合同中明确约定了员工中途离职时工资的结清时间，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么双方应按照约定履行。
   • 同样，如果公司规章制度中有关于员工离职时工资结清时间的明确规定，且该规定已经过民主程序制定并公示，且不违反法律法规的强制性规定，那么员工也应遵守。

2. 法律法规的强制性规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者享有取得劳动报酬的权利，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
   • 若劳动合同或公司规章制度中未明确约定员工中途离职时工资的结清时间，或者约定违反了法律法规的强制性规定（如约定过长的结清时间，损害了劳动者的合法权益），则老板要求三个月内结清工资的做法可能违法。

3. 实际操作中的建议：

   • 对于员工而言，若劳动合同或公司规章制度中有关于离职时工资结清时间的明确约定，且该约定合理合法，那么应遵守约定。若认为约定不合理或违法，可以与用人单位协商修改，或者向劳动监察部门投诉。
   • 对于用人单位而言，应制定合理合法的劳动合同和公司规章制度，明确员工离职时工资的结清时间，并确保该约定不违反法律法规的强制性规定。同时，应按时足额支付员工工资，避免引发劳动争议。

可能后果：

• 若老板的做法违法，员工有权向劳动监察部门投诉，要求用人单位按时足额支付工资。劳动监察部门将依法进行调查处理，并可能对用人单位进行处罚。
• 若因工资支付问题引发劳动争议，员工还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。

进一步思考：

• 在实际操作中，员工应仔细阅读劳动合同和公司规章制度，了解自己的权利和义务。若对约定有疑问或认为不合理，应及时与用人单位沟通协商。
• 用人单位也应加强法律法规的学习和培训，确保自己的规章制度和劳动合同合法合规，避免引发不必要的劳动争议。

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