上级检察机关在公安机关不服不起诉决定申请复核时，是可以调取新证据的。以下从多个角度对此问题进行分析：
法律依据与程序规定
检察机关的审查权：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》及相关司法解释，检察机关在审查起诉阶段具有独立的审查权，包括对案件事实、证据的全面审查。当公安机关对检察机关的不起诉决定不服并申请复核时，上级检察机关作为复核机关，有权对案件进行重新审查。
调取新证据的权力：
- 在复核过程中，上级检察机关为了全面、客观地审查案件，有权根据需要调取新的证据。这包括但不限于要求公安机关补充提供证据、自行调查取证或委托其他机关调查取证等。
实际操作与考量因素
证据的充分性与必要性：
- 上级检察机关在决定是否调取新证据时，会综合考虑案件的实际情况、证据的充分性以及调取新证据的必要性。如果现有证据已经足够支持不起诉决定，且没有新的线索或证据表明可能存在错误，那么上级检察机关可能不会调取新证据。
保障当事人权益：
- 调取新证据的过程中，上级检察机关会注重保障当事人的合法权益，包括犯罪嫌疑人的辩护权、被害人的申诉权等。确保调取证据的程序合法、合规，避免侵犯当事人的合法权益。
可能的法律后果与影响
对不起诉决定的影响：
- 如果上级检察机关在复核过程中调取了新证据，并认为这些证据足以改变原不起诉决定，那么它可能会撤销原不起诉决定，并指令下级检察机关重新审查或直接提起公诉。
对公安机关与检察机关关系的影响：
- 公安机关对检察机关的不起诉决定申请复核，以及上级检察机关的复核结果，都可能对公安机关与检察机关之间的关系产生一定影响。因此，在处理此类案件时，双方应保持沟通、协作，共同维护司法公正与效率。
建议与注意事项
公安机关在申请复核时：
- 应提供充分的理由和证据，说明原不起诉决定可能存在的错误或不足。同时，应积极配合上级检察机关的调查工作，提供必要的协助和支持。
上级检察机关在复核时：
- 应严格依法行使审查权，确保复核程序的合法性和公正性。在调取新证据时，应注重证据的合法性、真实性和关联性，避免使用非法证据或无关证据。
当事人应积极参与：
- 犯罪嫌疑人和被害人应积极参与复核过程，行使自己的合法权益。如认为复核结果可能侵犯自己的权益，可以依法提出申诉或控告。
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