结论：在检察院作出不起诉决定后，若公安机关在没有新证据的情况下，一般不可以直接在两年后进行复查。但需注意，若公安机关认为不起诉决定有错误，可依法提出复议或复核，且法律并未明确限制提出复议或复核的时间，不过实践中通常会在合理期限内提出。
分析说明：
不起诉决定的性质：
- 检察院的不起诉决定是对案件的一种法律处理方式，意味着在现有证据下，检察院认为不构成犯罪或犯罪情节轻微，不需要追究刑事责任。
公安机关的复查权：
- 公安机关在接到检察院的不起诉决定后，若认为该决定有错误，可以依法向上一级检察院提出复议。
- 如果公安机关对复议决定仍不服，还可以向上一级检察院申请复核。
- 但法律并未规定公安机关可以在不起诉决定作出后任意时间点，如两年后，仅凭原有证据进行复查。复查通常需要基于新的证据或事实，且需通过复议或复核等法定程序进行。
复议与复核的时限：
- 法律并未明确规定公安机关提出复议或复核的具体时间限制，但实践中，公安机关通常会在收到不起诉决定书后的合理期限内提出，以确保案件的及时处理和司法效率。
- 若公安机关长时间不提出复议或复核，且没有新证据出现，再提出复查的请求可能缺乏法律依据和合理性。
特殊情况下的处理：
- 如果公安机关在两年后发现了新的证据，且这些证据足以改变原不起诉决定的结论，那么公安机关可以依法重新启动侦查程序，并向检察院提交新的证据，请求重新审查案件。
建议与行动：
- 对于公安机关而言，若认为不起诉决定有误，应及时在合理期限内提出复议或复核，避免错过最佳时机。
- 若公安机关在长时间后发现了新证据，应立即依法处理，并重新提交给检察院进行审查。
- 对于当事人而言，若对检察院的不起诉决定或公安机关的处理有异议，可以依法寻求法律救济，如向相关部门申诉或提起诉讼。
法律后果：
- 若公安机关未经法定程序，擅自对已作出不起诉决定的案件进行复查，可能构成程序违法，相关决定或行为可能被撤销或纠正。
- 若公安机关在合理期限内未提出复议或复核，且没有新证据出现，再提出复查请求可能不会被受理或支持。