结论前置：店里扣工资是否违法，需根据具体情况判断。若无法定事由或违反相关规定扣除工资，则属于违法行为。以下从多个角度为您详细分析：

一、法定允许扣除工资的情形

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及《工资支付暂行规定》第十五条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，且不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。但存在以下法定允许扣除的情形时，扣除工资是合法的：

1. 代扣代缴的个人所得税；
2. 代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；
3. 法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；
4. 法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。

二、公司规定与员工同意的情况

如果公司有明确的规章制度，并且员工在入职时或后续签署了相关协议，同意在某些情况下接受工资扣除，那么这种扣除可能是合法的。但前提是这些规定必须合理且不违反法律法规。例如，若公司规定因员工严重违反公司规章制度造成重大损失时，可扣除一定比例的工资作为赔偿，且该比例在合理范围内，同时扣除后的工资不低于当地最低工资标准，那么这种扣除是合法的。

三、经济损失赔偿的扣除

如果员工因个人原因给用人单位造成经济损失，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但赔偿的扣除需遵循一定限度：

• 每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%；
• 扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。

例如，若员工当月工资为5000元，因个人原因给公司造成损失，公司最多只能扣除1000元（即5000元的20%）作为赔偿，且扣除后员工剩余工资不得低于当地最低工资标准。

四、无理由或乱扣工资的情况

如店长仅因员工迟到几分钟、与顾客发生小争执等轻微原因就扣工资，或者扣除的金额过多，甚至影响到员工的最低生活标准，这种扣除是违法的。员工有权要求店长或用人单位说明扣工资的理由，并提供相应证据。若无法提供合理理由或证据，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

五、投诉与维权途径

如果员工认为店长扣工资的行为违法，首先应与店长或用人单位进行沟通协商，尝试解决问题。若协商不成，员工可以采取以下措施：

1. 向劳动监察部门投诉：劳动监察部门有权对用人单位的违法行为进行调查和处理；
2. 申请劳动仲裁：员工可以向当地劳动仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位支付被扣除的工资及可能的赔偿金。

总结与建议：店里扣工资是否违法，需根据具体情况判断。在扣除工资前，用人单位应确保有明确的法律依据或合理的规章制度作为支撑，并遵循相关的限度和程序。员工也应了解自己的权益，对于无理由或不合法的扣工资行为，要勇于通过合法途径进行维权。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。