结论：员工长期旷工被开除，人力资源部是否会被追责，需视具体情况而定，包括公司规章制度、人力资源部的处理流程是否合规以及是否存在过错等。
分析说明：
公司规章制度的角度：
- 如果公司有明确的规章制度，规定员工长期旷工属于严重违反公司纪律的行为，并明确规定了相应的处罚措施，包括开除，且这些规章制度已经通过合法程序（如职工代表大会或全体职工讨论、协商确定，并公示或告知劳动者）制定并公布，那么公司依据这些规章制度开除员工是合法的。
- 在此情况下，人力资源部作为执行公司规章制度的部门，如果其开除员工的决定是基于公司规章制度，且处理流程合规，那么人力资源部通常不会被追责。
人力资源部处理流程的角度：
- 人力资源部在处理员工旷工问题时，应遵循一定的程序，如先进行警告、通知员工返岗、进行纪律处分等，如果直接跳过这些程序而开除员工，可能构成程序违法。
- 如果人力资源部在处理过程中存在过错，如未按照公司规章制度或法律法规的规定进行操作，或者存在滥用职权、徇私舞弊等行为，那么人力资源部及其相关责任人员可能会被追责。
法律法规的角度：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。但用人单位在解除劳动合同时，应当遵循法定程序，如提前通知工会、告知劳动者解除理由等。
- 如果人力资源部在开除员工时未遵循这些法定程序，或者开除决定缺乏合法依据，那么人力资源部可能会面临法律责任，包括但不限于支付赔偿金、恢复劳动关系等。
行动建议：
- 对于公司而言：应确保公司规章制度合法合规，并明确规定员工旷工的处理流程和处罚措施。同时，人力资源部在处理员工旷工问题时，应严格遵循公司规章制度和法律法规的规定，确保处理流程的合法性和合规性。
- 对于员工而言：如果认为公司或人力资源部的处理决定存在违法或不当之处，可以依法向劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁，维护自己的合法权益。
- 对于人力资源部工作人员而言：在处理员工旷工等纪律问题时，应谨慎行事，确保自己的处理决定有合法依据且程序合规，以避免被追责。
特殊场景提醒：
- 如果员工旷工行为确实严重违反了公司规章制度，且人力资源部的处理流程完全合规，那么人力资源部通常不会被追责。
- 如果员工旷工行为虽然存在，但人力资源部在处理过程中存在过错或程序违法，那么人力资源部及其相关责任人员可能会面临法律责任。
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