您好，关于您在工作时腰扭伤后公司应如何赔偿的问题，这主要取决于是否构成工伤以及工伤的等级。以下是我为您详细梳理的赔偿流程和标准：

一、工伤认定

1. 申请时限：首先，您或您的公司应在事故伤害发生之日起30日内，向统筹地区的社会保险行政部门提出工伤认定申请。如果公司未在规定时间内提出申请，您或您的近亲属、工会组织也可以在事故伤害发生之日起1年内，直接提出工伤认定申请。

2. 所需材料：申请工伤认定时，需要提交工伤认定申请表、与用人单位存在劳动关系的证明材料（如劳动合同、工资发放记录等）、以及医疗机构的诊断证明等。

3. 认定结果：社会保险行政部门将在受理申请之日起60日内作出工伤认定决定，并出具工伤认定书。如果认定为工伤，您就有权享受相应的工伤待遇。

二、治疗与费用支付

1. 医疗费用：治疗工伤所需的费用，如果符合工伤保险诊疗项目目录、药品目录以及住院服务标准，将由工伤保险基金支付。如果公司未为您缴纳工伤保险，那么这些费用将由公司承担。

2. 住院伙食补助费：如果您需要住院治疗，公司还应按照本单位因公出差伙食补助标准的70%支付住院伙食补助费，或者按照当地国家机关工作人员出差伙食补助金标准确定。

三、停工留薪期待遇

1. 停工留薪期工资：在停工留薪期内，您的原工资福利待遇将保持不变，由公司按月支付。停工留薪期一般不超过12个月，但如果伤情严重或者情况特殊，可以适当延长，但延长不得超过12个月。

2. 护理费：如果您在停工留薪期内生活不能自理需要护理，公司应负责提供护理。如果经劳动能力鉴定委员会确认需要生活护理，那么从工伤保险基金中按月支付生活护理费，标准根据您的生活自理障碍程度确定。

四、劳动能力鉴定与赔偿

1. 鉴定时机：当您的伤情相对稳定后，如果存在残疾或者影响劳动能力的情况，应申请劳动能力鉴定。

2. 鉴定机构：劳动能力鉴定由设区的市级劳动能力鉴定委员会负责组织实施。

3. 赔偿项目：根据鉴定结果，您可能享有以下赔偿项目：

   • 一次性伤残补助金：根据您的伤残等级，从工伤保险基金中支付一定月数的本人工资作为补助金。具体标准根据伤残等级确定，如七级伤残为13个月本人工资，八级伤残为11个月本人工资，以此类推。
   • 辅助器具费：如果您因日常生活或者就业需要安装辅助器具，费用由工伤保险基金或者公司承担。
   • 一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金：如果您被鉴定为五至十级伤残，并且在解除劳动关系时，可以获得这两项补助金。具体标准根据伤残等级和当地规定确定。

五、申请赔偿流程

1. 首先进行工伤认定申请。
2. 治疗期间保留所有相关费用凭证。
3. 根据伤情进行劳动能力鉴定。
4. 根据鉴定结果和相关规定，计算并申请领取各项赔偿金。

六、法律保障

如果公司未依法为您缴纳工伤保险或者拒不支付工伤赔偿，您有权向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

综上所述，如果您在工作时腰扭伤被认定为工伤，您有权按照法定程序申请赔偿，包括医疗费用、停工留薪期待遇、护理费、一次性伤残补助金等各项费用。公司应依法承担相应责任，确保您的权益得到妥善保障。希望这些信息能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。