结论前置：公司与员工签订的劳动合同如果不是本公司名义签订的，其合法性需根据具体情况判断，不能一概而论。关键在于双方实际关系是否符合劳动关系的特征，以及合同内容是否合法合规。
一、合法情况分析
关联公司或子公司签订：
- 如果公司与其关联公司或子公司之间存在合法的用工安排，且员工实际为该公司提供劳动，但合同由关联公司或子公司签订，这种情况在特定条件下可能是合法的。例如，集团内部调配员工，且员工对此知情并同意。但需注意，这种情况下仍需确保员工的权益不受损害，如社保缴纳、工资支付等。
劳务派遣：
- 在劳务派遣关系中，员工与劳务派遣公司签订劳动合同，但被派遣至实际用工单位工作。这种情况下，虽然劳动合同不是与实际用工单位签订，但符合劳务派遣的法律规定，是合法的。劳务派遣单位应当履行用人单位对劳动者的义务，包括签订劳动合同、支付劳动报酬、缴纳社会保险等。
二、不合法情况分析
规避法律责任：
- 如果公司为了规避劳动法规定的义务，如缴纳社会保险、支付经济补偿等，而故意不与员工签订本公司名义的劳动合同，而是通过其他不正当手段（如签订虚假劳务合同）来规避，则是不合法的。这种情况下，劳动仲裁机构或法院可能会认定双方存在事实劳动关系，公司仍需承担相应法律责任。
欺诈或胁迫：
- 如果公司在签订劳动合同时存在欺诈、胁迫等行为，导致员工在违背真实意愿的情况下签订了非本公司名义的劳动合同，那么该合同也是不合法的。员工有权请求确认合同无效，并要求公司承担相应法律责任。
三、法律建议
审查合同内容：
- 无论劳动合同是与哪家公司签订，都应仔细审查合同内容，确保合同条款合法合规，明确双方的权利义务。特别是要注意合同中的用工主体、工作内容、工作地点、劳动报酬、社会保险等关键条款。
保留证据：
- 在工作过程中，应保留好与工作相关的证据，如工作证、工资条、考勤记录等。这些证据在发生劳动争议时可能起到关键作用。
及时咨询：
- 如果对劳动合同的合法性或合同内容有疑问，应及时向我咨询。作为专业律师，我可以根据具体情况提供法律意见和帮助。
四、可能法律后果
如果合同合法：
- 如果劳动合同虽然不是与本公司签订，但符合上述合法情况的分析，那么该合同对双方具有约束力。双方应按照合同约定履行各自义务，否则可能承担违约责任。
如果合同不合法：
- 如果劳动合同存在规避法律责任、欺诈或胁迫等不合法情况，那么该合同可能被认定无效或部分无效。公司可能面临劳动仲裁机构的裁决或法院的判决，要求承担相应法律责任，如支付未签劳动合同的双倍工资、补缴社会保险、支付经济补偿等。
总之，公司与员工签订的劳动合同如果不是本公司名义签订的，其合法性需根据具体情况判断。在签订劳动合同时，应仔细审查合同内容，确保合法合规，并保留好相关证据。如有疑问，应及时向我咨询。