确认离职协议中关于放弃公积金权利的条款无效的案件，一般由用人单位所在地的住房公积金管理中心或法院管辖，具体取决于争议的性质和解决途径。以下从不同角度进行分析：

1. 行政处理途径：住房公积金管理中心
   根据《住房公积金管理条例》第三十七条、第三十八条，用人单位未依法为职工缴存住房公积金的，住房公积金管理中心具有行政执法权，可责令限期缴存。若离职协议中“放弃公积金”条款违反法律强制性规定（如《住房公积金管理条例》第二十条），职工可向当地住房公积金管理中心投诉，由其通过行政手段确认条款无效并追缴公积金。此时管辖机构为用人单位所在地的住房公积金管理中心。

2. 劳动争议仲裁或诉讼途径：劳动仲裁委或法院
   若职工与用人单位就离职协议效力产生争议（如用人单位以“放弃公积金”条款为由拒绝缴存），可依据《劳动争议调解仲裁法》第二条申请劳动仲裁，或直接向法院起诉。此时管辖机构为：

   • 劳动仲裁委：合同履行地或用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会；
     
   • 法院：若对仲裁结果不服，可向用人单位所在地或合同履行地的基层法院起诉。
     关键点：公积金争议属于劳动争议范畴，但需注意部分地区法院可能要求先经过住房公积金管理中心行政处理程序。

3. 条款无效的法律依据
   根据《劳动合同法》第二十六条，违反法律、行政法规强制性规定的劳动合同条款无效。公积金缴存是用人单位的法定义务（《住房公积金管理条例》第二十条），职工无权通过协议放弃，因此相关条款自始无效，无需通过诉讼或仲裁确认，但需通过上述途径主张权利。

建议行动步骤：

1. 优先向用人单位所在地的住房公积金管理中心投诉，要求其责令用人单位缴存；
   
2. 若用人单位拒绝配合，可申请劳动仲裁或向法院起诉，主张条款无效并要求补缴；
   
3. 保留离职协议、工资记录等证据，以证明劳动关系及公积金缴存义务。
   

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