结论：职务侵占行为本身不影响劳动仲裁的进行，但职务侵占案件不属于劳动仲裁的受案范围，两者在案件性质、处理程序及法律依据上存在根本差异。
一、案件性质差异
劳动仲裁：主要处理用人单位与劳动者之间基于劳动关系产生的民事争议，如劳动合同的履行、解除，工资报酬、福利待遇、工作时间、休息休假、社会保险等纠纷。这些争议主要涉及双方民事权利的享有与义务的承担。
职务侵占：则属于刑事犯罪范畴，特指公司、企业或其他单位人员利用职务便利，将本单位财物非法占为己有且数额较大的行为。此类行为严重侵害了单位财产权，行为人需承担刑事责任。
二、处理程序不同
劳动仲裁：作为解决劳动争议的前置程序，依据劳动法律法规及相关政策进行调解、仲裁，旨在快速、有效地化解劳资矛盾。如果劳动者对仲裁结果不服，还可以向人民法院提起诉讼。
职务侵占案件：则需遵循刑事诉讼程序，由公安机关立案侦查，检察机关提起公诉，人民法院依法审判并定罪量刑。这一过程涉及刑事法律的适用，旨在追究犯罪者的刑事责任。
三、法律依据明确
劳动仲裁：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条的规定，劳动仲裁适用于确认劳动关系、劳动合同订立履行、除名辞退辞职离职、工作时间休息休假、社会保险福利培训劳动保护、劳动报酬工伤医疗费经济补偿赔偿金等劳动争议。职务侵占并不属于上述任何一类劳动争议，因此不属于劳动仲裁机构的受案范围。
职务侵占：依据《中华人民共和国刑法》第二百七十一条的规定，公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，将面临刑事处罚。
四、实际操作建议
对于职务侵占行为：如果劳动者发现用人单位相关人员存在职务侵占行为，应及时向公安机关报案，由公安机关按照刑事诉讼程序进行处理。这有助于维护单位财产安全，也是对自身合法权益的有效保护。
对于劳动争议：如果劳动者与用人单位之间存在劳动争议，如工资拖欠、解除劳动合同等，可以依法向劳动仲裁机构申请仲裁。在申请仲裁时，应准备充分的证据材料，如劳动合同、工资条、工作记录等，以支持自己的主张。
总结：职务侵占行为与劳动仲裁在性质、处理程序及法律依据上均存在显著差异。职务侵占案件不能通过劳动仲裁来处理，而应依法向公安机关报案。如果劳动者与用人单位之间存在劳动争议，可以依法向劳动仲裁机构申请仲裁。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。